Ballgown bridges the gap between transcriptome assembly and expression analysis

被引：582

作者：

Frazee, Alyssa C. ^{[1
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Pertea, Geo ^{[2
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Jaffe, Andrew E. ^{[1
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Langmead, Ben ^{[1
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Salzberg, Steven L. ^{[1
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Leek, Jeffrey T. ^{[1
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机构：

[1] Johns Hopkins Bloomberg Sch Publ Hlth, Dept Biostat, Baltimore, MD 21205 USA

[2] Johns Hopkins Univ, Ctr Computat Biol, Baltimore, MD USA

[3] Johns Hopkins Univ, Sch Med, McKusick Nathans Inst Genet Med, Baltimore, MD USA

[4] Lieber Inst Brain Dev, Baltimore, MD USA

[5] Johns Hopkins Univ, Dept Comp Sci, Baltimore, MD 21218 USA

来源：

NATURE BIOTECHNOLOGY | 2015年 / 33卷 / 03期

基金：

美国国家卫生研究院;

关键词：

RNA-SEQ DATA; GENE-EXPRESSION; GENOME-WIDE; QUANTIFICATION; BIOCONDUCTOR; ALIGNMENT; MODEL;

D O I：

10.1038/nbt.3172

中图分类号：

Q81 [生物工程学（生物技术）]; Q93 [微生物学];

学科分类号：

071005 ; 0836 ; 090102 ; 100705 ;

摘要：

引用

页码：243 / 246

页数：5

共 34 条

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