Morphological and molecular identification of Diaporthe species in south-western China, with description of eight new species

被引:41
作者
Sun, Wenxiu [1 ]
Huang, Shengting [1 ]
Xia, Jiwen [2 ]
Zhang, Xiuguo [2 ]
Li, Zhuang [2 ]
机构
[1] Yangtze Univ, Coll Life Sci, Jingzhou 434025, Hubei, Peoples R China
[2] Shandong Agr Univ, Shandong Prov Key Lab Biol Vegetable Dis & Insect, Coll Plant Protect, Tai An 271018, Shandong, Peoples R China
基金
中国国家自然科学基金; 中国博士后科学基金;
关键词
Diaporthaceae; Diaporthales; phylogeny; taxonomy; 8 new taxa; BAYESIAN PHYLOGENETIC INFERENCE; STEM-END ROT; 1ST REPORT; SP; NOV; PHOMOPSIS; DIVERSITY; DIEBACK; COMPLEX; MRBAYES; REVEAL;
D O I
10.3897/mycokeys.77.59852
中图分类号
Q93 [微生物学];
学科分类号
071005 ; 100705 ;
摘要
Diaporthe species have often been reported as plant pathogens, endophytes and saprophytes, commonly isolated from a wide range of infected plant hosts. In the present study, twenty strains obtained from leaf spots of twelve host plants in Yunnan Province of China were isolated. Based on a combination of morphology, culture characteristics and multilocus sequence analysis of the rDNA internal transcribed spacer region (ITS), translation elongation factor 1-alpha (TEF), beta-tubulin (TUB), calmodulin (CAL), and histone (HIS) genes, these strains were identified as eight new species: Diaporthe camelliae-sinensis, D. grandiflori, D. heliconiae, D. heterostemmatis, D. litchii, D. lutescens, D. melastomatis, D. pungensis and two previously described species, D. subclavata and D. tectonendophytica. This study showed high species diversity of Diaporthe in tropical rain forests and its hosts in south-western China.
引用
收藏
页码:65 / 95
页数:31
相关论文
共 60 条
[1]  
Broge M, 2020, PLANT DIS, V104, P1550, DOI [10.1094/PDIS-08-19-1655-PDN, 10.1094/PDIS-08-19-655-PDN]
[2]  
Cai L, 2009, FUNGAL DIVERS, V39, P183
[3]  
Crous P. W., 2020, Fungal Systematics and Evolution, V6, P157, DOI 10.3114/fuse.2020.06.09
[4]   Fungal Planet description sheets: 785-867 [J].
Crous, P. W. ;
Luangsa-ard, J. J. ;
Wingfield, M. J. ;
Carnegie, A. J. ;
Hernandez-Restrepo, M. ;
Lombard, L. ;
Roux, J. ;
Barreto, R. W. ;
Baseia, I. G. ;
Cano-Lira, J. F. ;
Martin, M. P. ;
Morozova, O. V. ;
Stchigel, A. M. ;
Summerell, B. A. ;
Brandrud, T. E. ;
Dima, B. ;
Garcia, D. ;
Giraldo, A. ;
Guarro, J. ;
Gusmao, L. F. P. ;
Khamsuntorn, P. ;
Noordeloos, M. E. ;
Nuankaew, S. ;
Pinruan, U. ;
Rodriguez-Andrade, E. ;
Souza-Motta, C. M. ;
Thangavel, R. ;
van Iperen, A. L. ;
Abreu, V. P. ;
Accioly, T. ;
Alves, J. L. ;
Andrade, J. P. ;
Bahram, M. ;
Baral, H. -O. ;
Barbier, E. ;
Barnes, C. W. ;
Bendiksen, E. ;
Bernard, E. ;
Bezerra, J. D. P. ;
Bezerra, J. L. ;
Bizio, E. ;
Blair, J. E. ;
Bulyonkova, T. M. ;
Cabral, T. S. ;
Caiafa, M. V. ;
Cantillo, T. ;
Colman, A. A. ;
Conceicao, L. B. ;
Cruz, S. ;
Cunha, A. O. B. .
PERSOONIA, 2018, 41 :238-417
[5]   Fungal Planet description sheets: 716-784 [J].
Crous, P. W. ;
Wingfield, M. J. ;
Burgess, T. I. ;
Hardy, G. E. St. J. ;
Gene, J. ;
Guarro, J. ;
Baseia, I. G. ;
Garcia, D. ;
Gusmao, L. F. P. ;
Souza-Motta, C. M. ;
Thangavel, R. ;
Adamcik, S. ;
Barili, A. ;
Barnes, C. W. ;
Bezerra, J. D. P. ;
Bordallo, J. J. ;
Cano-Lira, J. F. ;
de Oliveira, R. J. V. ;
Ercole, E. ;
Hubka, V. ;
Iturrieta-Gonzalez, I. ;
Kubatova, A. ;
Martin, M. P. ;
Moreau, P. -A. ;
Morte, A. ;
Ordonez, M. E. ;
Rodriguez, A. ;
Stchigel, A. M. ;
Vizzini, A. ;
Abdollahzadeh, J. ;
Abreu, V. P. ;
Adamcikova, K. ;
Albuquerque, G. M. R. ;
Alexandrova, A. V. ;
Duarte, E. Alvarez ;
Armstrong-Cho, C. ;
Banniza, S. ;
Barbosa, R. N. ;
Bellanger, J. -M. ;
Bezerra, J. L. ;
Cabral, T. S. ;
Cabon, M. ;
Caicedo, E. ;
Cantillo, T. ;
Carnegie, A. J. ;
Carmo, L. T. ;
Castaneda-Ruiz, R. F. ;
Clement, C. R. ;
Cmokova, A. ;
Conceicao, L. B. .
PERSOONIA, 2018, 40 :240-393
[6]   Fungal Planet description sheets: 400-468 [J].
Crous, P. W. ;
Wingfield, M. J. ;
Richardson, D. M. ;
Le Roux, J. J. ;
Strasberg, D. ;
Edwards, J. ;
Roets, F. ;
Hubka, V. ;
Taylor, P. W. J. ;
Heykoop, M. ;
Martin, M. P. ;
Moreno, G. ;
Sutton, D. A. ;
Wiederhold, N. P. ;
Barnes, C. W. ;
Carlavilla, J. R. ;
Gene, J. ;
Giraldo, A. ;
Guarnaccia, V. ;
Guarro, J. ;
Hernandez-Restrepo, M. ;
Kolarik, M. ;
Manjon, J. L. ;
Pascoe, I. G. ;
Popov, E. S. ;
Sandoval-Denis, M. ;
Woudenberg, J. H. C. ;
Acharya, K. ;
Alexandrova, A. V. ;
Alvarado, P. ;
Barbosa, R. N. ;
Baseia, I. G. ;
Blanchette, R. A. ;
Boekhout, T. ;
Burgess, T. I. ;
Cano-Lira, J. F. ;
Cmokova, A. ;
Dimitrov, R. A. ;
Dyakov, M. Yu. ;
Duenas, M. ;
Dutta, A. K. ;
Esteve-Raventos, F. ;
Fedosova, A. G. ;
Fournier, J. ;
Gamboa, P. ;
Gouliamova, D. E. ;
Grebenc, T. ;
Groenewald, M. ;
Hanse, B. ;
Hardy, G. E. St. J. .
PERSOONIA, 2016, 36 :316-458
[7]   Fungal Planet description sheets: 214-280 [J].
Crous, P. W. ;
Shivas, R. G. ;
Quaedvlieg, W. ;
van der Bank, M. ;
Zhang, Y. ;
Summerell, B. A. ;
Guarro, J. ;
Wingfield, M. J. ;
Wood, A. R. ;
Alfenas, A. C. ;
Braun, U. ;
Cano-Lira, J. F. ;
Garcia, D. ;
Marin-Felix, Y. ;
Alvarado, P. ;
Andrade, J. P. ;
Armengol, J. ;
Assefa, A. ;
den Breeyen, A. ;
Camele, I. ;
Cheewangkoon, R. ;
De Souza, J. T. ;
Duong, T. A. ;
Esteve-Raventos, F. ;
Fournier, J. ;
Frisullo, S. ;
Garcia-Jimenez, J. ;
Gardiennet, A. ;
Gene, J. ;
Hernandez-Restrepo, M. ;
Hirooka, Y. ;
Hospenthal, D. R. ;
King, A. ;
Lechat, C. ;
Lombard, L. ;
Mang, S. M. ;
Marbach, P. A. S. ;
Marincowitz, S. ;
Marin-Felix, Y. ;
Montano-Mata, N. J. ;
Moreno, G. ;
Perez, C. A. ;
Sierra, A. M. Perez ;
Robertson, J. L. ;
Roux, J. ;
Rubio, E. ;
Schumacher, R. K. ;
Stchigel, A. M. ;
Sutton, D. A. ;
Tan, Y. P. .
PERSOONIA, 2014, 32 :184-306
[8]   Fungal pathogens of Proteaceae [J].
Crous, P. W. ;
Summerell, B. A. ;
Swart, L. ;
Denman, S. ;
Taylor, J. E. ;
Bezuidenhout, C. M. ;
Palm, M. E. ;
Marincowitz, S. ;
Groenewald, J. Z. .
PERSOONIA, 2011, 27 :20-45
[9]   Fungal Planet description sheets: 69-91 [J].
Crous, P. W. ;
Groenewald, J. Z. ;
Shivas, R. G. ;
Edwards, J. ;
Seifert, K. A. ;
Alfenas, A. C. ;
Alfenas, R. F. ;
Burgess, T. I. ;
Carnegie, A. J. ;
Hardy, G. E. St. J. ;
Hiscock, N. ;
Hueberli, D. ;
Jung, T. ;
Louis-Seize, G. ;
Okada, G. ;
Pereira, O. L. ;
Stukely, M. J. C. ;
Wang, W. ;
White, G. P. ;
Young, A. J. ;
McTaggart, A. R. ;
Pascoe, I. G. ;
Porter, I. J. ;
Quaedvlieg, W. .
PERSOONIA, 2011, 26 :108-156
[10]  
Crous PW, 2004, STUD MYCOL, P415