GreeNC 2.0: a comprehensive database of plant long non-coding RNAs

被引：42

作者：

Di Marsico, Marco ^{[1
]}

Paytuvi Gallart, Andreu ^{[2
]}

Sanseverino, Walter ^{[2
]}

Aiese Cigliano, Riccardo ^{[2
]}

机构：

[1] Univ Perugia, Dipartimento Sci Agr Alimentari & Ambientali, Borgo XX Giugno 74, I-06121 Perugia, Italy

[2] Sequentia Biotech SL, Carrer Pamplona 88, Barcelona 08018, Spain

来源：

NUCLEIC ACIDS RESEARCH | 2022年 / 50卷 / D1期

基金：

欧盟地平线“2020”;

关键词：

GENOME PROVIDES INSIGHT; DRAFT GENOME; EVOLUTION; SEQUENCE; RESOURCE; TRANSCRIPTOME; ANNOTATION; PROGENITOR;

D O I：

10.1093/nar/gkab1014

中图分类号：

Q5 [生物化学]; Q7 [分子生物学];

学科分类号：

071010 ; 081704 ;

摘要：

The Green Non-Coding Database (GreeNC) is one of the reference databases for the study of plant long non-coding RNAs (lncRNAs). Here we present our most recent update where 16 species have been updated, while 78 species have been added, resulting in the annotation of more than 495 000 lncRNAs. Moreover, sequence clustering was applied providing information about sequence conservation and gene families. The current version of the database is available at: http://greenc.sequentiabiotech.com/wiki2/Main_Page.

引用

页码：D1442 / D1447

页数：6

共 88 条

[1] High-Resolution Linkage Map and Chromosome-Scale Genome Assembly for Cassava (Manihot esculenta Crantz) from 10 Populations [J].

Alaba, Oluwafemi A. ;

Bredeson, Jessen V. ;

Egesi, Chiedozie N. ;

Esuma, Williams ;

Ezenwaka, Lydia ;

Ferguson, Morag E. ;

Ha, Cindy M. ;

Hall, Megan ;

Herselman, Liezel ;

Ikpan, Andrew ;

Kafiriti, Elly ;

Kanju, Edward ;

Kapinga, Fortunus ;

Karugu, Arthur ;

Kawuki, Robert ;

Kimata, Bernadetha ;

Kimurto, Paul ;

Kulakow, Peter ;

Kulembeka, Heneriko ;

Kusolwa, Paul ;

Lyons, Jessica B. ;

Masumba, Esther ;

van de Merwe, Albe ;

Mkamilo, Geoffrey ;

Myburg, Alexander A. ;

Nwaogu, Ahamefule ;

Nzuki, Inosters ;

Olasanmi, Bunmi ;

Okogbenin, Emmanuel ;

Onyegbule, Onyeyirichi ;

Owuoche, James ;

Pariyo, Anthony ;

Prochnik, Simon E. ;

Rabbi, Ismail Y. ;

Rokhsar, Daniel S. ;

Rounsley, Steve ;

Salum, Kasele ;

Shuaibu, Kahya S. ;

Sichalwe, Caroline ;

Stephen, Mary .

G3-GENES GENOMES GENETICS, 2015, 5 (01) :133-144

[2] Transposons played a major role in the diversification between the closely related almond and peach genomes: results from the almond genome sequence [J].

Alioto, Tyler ;

Alexiou, Konstantinos G. ;

Bardil, Amelie ;

Barteri, Fabio ;

Castanera, Raul ;

Cruz, Fernando ;

Dhingra, Amit ;

Duval, Henri ;

Fernandez i Marti, Angel ;

Frias, Leonor ;

Galan, Beatriz ;

Garcia, Jose L. ;

Howad, Werner ;

Gomez-Garrido, Jessica ;

Gut, Marta ;

Julca, Irene ;

Morata, Jordi ;

Puigdomenech, Pere ;

Ribeca, Paolo ;

Rubio Cabetas, Maria J. ;

Vlasova, Anna ;

Wirthensohn, Michelle ;

Garcia-Mas, Jordi ;

Gabaldon, Toni ;

Casacuberta, Josep M. ;

Arus, Pere .

PLANT JOURNAL, 2020, 101 (02) :455-472

[3] Shifting the limits in wheat research and breeding using a fully annotated reference genome [J].

Appels, Rudi ;

Eversole, Kellye ;

Feuillet, Catherine ;

Keller, Beat ;

Rogers, Jane ;

Stein, Nils ;

Pozniak, Curtis J. ;

Choulet, Frederic ;

Distelfeld, Assaf ;

Poland, Jesse ;

Ronen, Gil ;

Sharpe, Andrew G. ;

Pozniak, Curtis ;

Barad, Omer ;

Baruch, Kobi ;

Keeble-Gagnere, Gabriel ;

Mascher, Martin ;

Ben-Zvi, Gil ;

Josselin, Ambre-Aurore ;

Himmelbach, Axel ;

Balfourier, Francois ;

Gutierrez-Gonzalez, Juan ;

Hayden, Matthew ;

Koh, ChuShin ;

Muehlbauer, Gary ;

Pasam, Raj K. ;

Paux, Etienne ;

Rigault, Philippe ;

Tibbits, Josquin ;

Tiwari, Vijay ;

Spannagl, Manuel ;

Lang, Daniel ;

Gundlach, Heidrun ;

Haberer, Georg ;

Mayer, Klaus F. X. ;

Ormanbekova, Danara ;

Prade, Verena ;

Simkova, Hana ;

Wicker, Thomas ;

Swarbreck, David ;

Rimbert, Helene ;

Felder, Marius ;

Guilhot, Nicolas ;

Kaithakottil, Gemy ;

Keilwagen, Jens ;

Leroy, Philippe ;

Lux, Thomas ;

Twardziok, Sven ;

Venturini, Luca ;

Juhasz, Angela .

SCIENCE, 2018, 361 (6403) :661-+

[4] R-Loop Mediated trans Action of the APOLO Long Noncoding RNA [J].

Ariel, Federico ;

Lucero, Leandro ;

Christ, Aurelie ;

Mammarella, Maria Florencia ;

Jegu, Teddy ;

Veluchamy, Alaguraj ;

Mariappan, Kiruthiga ;

Latrasse, David ;

Blein, Thomas ;

Liu, Chang ;

Benhamed, Moussa ;

Crespi, Martin .

MOLECULAR CELL, 2020, 77 (05) :1055-+

[5] Wild emmer genome architecture and diversity elucidate wheat evolution and domestication [J].

Avni, Raz ;

Nave, Moran ;

Barad, Omer ;

Baruch, Kobi ;

Twardziok, Sven O. ;

Gundlach, Heidrun ;

Hale, Iago ;

Mascher, Martin ;

Spannagl, Manuel ;

Wiebe, Krystalee ;

Jordan, Katherine W. ;

Golan, Guy ;

Deek, Jasline ;

Ben-Zvi, Batsheva ;

Ben-Zvi, Gil ;

Himmelbach, Axel ;

MacLachlan, Ron P. ;

Sharpe, Andrew G. ;

Fritz, Allan ;

Ben-David, Roi ;

Budak, Hikmet ;

Fahima, Tzion ;

Korol, Abraham ;

Faris, Justin D. ;

Hernandez, Alvaro ;

Mikel, Mark A. ;

Levy, Avraham A. ;

Steffenson, Brian ;

Maccaferri, Marco ;

Tuberosa, Roberto ;

Cattivelli, Luigi ;

Faccioli, Primetta ;

Ceriotti, Aldo ;

Kashkush, Khalil ;

Pourkheirandish, Mohammad ;

Komatsuda, Takao ;

Eilam, Tamar ;

Sela, Hanan ;

Sharon, Amir ;

Ohad, Nir ;

Chamovitz, Daniel A. ;

Mayer, Klaus F. X. ;

Stein, Nils ;

Ronen, Gil ;

Peleg, Zvi ;

Pozniak, Curtis J. ;

Akhunov, Eduard D. ;

Distelfeld, Assaf .

SCIENCE, 2017, 357 (6346) :93-96

[6] The sunflower genome provides insights into oil metabolism, flowering and Asterid evolution [J].

Badouin, Helene ;

Gouzy, Jerome ;

Grassa, Christopher J. ;

Murat, Florent ;

Staton, S. Evan ;

Cottret, Ludovic ;

Lelandais-Briere, Christine ;

Owens, Gregory L. ;

Carrere, Sebastien ;

Mayjonade, Baptiste ;

Legrand, Ludovic ;

Gill, Navdeep ;

Kane, Nolan C. ;

Bowers, John E. ;

Hubner, Sariel ;

Bellec, Arnaud ;

Berard, Aurelie ;

Berges, Helene ;

Blanchet, Nicolas ;

Boniface, Marie-Claude ;

Brunel, Dominique ;

Catrice, Olivier ;

Chaidir, Nadia ;

Claudel, Clotilde ;

Donnadieu, Cecile ;

Faraut, Thomas ;

Fievet, Ghislain ;

Helmstetter, Nicolas ;

King, Matthew ;

Knapp, Steven J. ;

Lai, Zhao ;

Le Paslier, Marie-Christine ;

Lippi, Yannick ;

Lorenzon, Lolita ;

Mandel, Jennifer R. ;

Marage, Gwenola ;

Marchand, Gwenaelle ;

Marquand, Elodie ;

Bret-Mestries, Emmanuelle ;

Morien, Evan ;

Nambeesan, Savithri ;

Thuy Nguyen ;

Pegot-Espagnet, Prune ;

Pouilly, Nicolas ;

Raftis, Frances ;

Sallet, Erika ;

Schiex, Thomas ;

Thomas, Justine ;

Vandecasteele, Celine ;

Vares, Didier .

NATURE, 2017, 546 (7656) :148-+

[7] Repbase Update, a database of repetitive elements in eukaryotic genomes [J].

Bao, Weidong ;

Kojima, Kenji K. ;

Kohany, Oleksiy .

MOBILE DNA, 2015, 6

[8] Construction of a map-based reference genome sequence for barley, Hordeum vulgare L. [J].

Beier, Sebastian ;

Himmelbach, Axel ;

Colmsee, Christian ;

Zhang, Xiao-Qi ;

Barrero, Roberto A. ;

Zhang, Qisen ;

Li, Lin ;

Bayer, Micha ;

Bolser, Daniel ;

Taudien, Stefan ;

Groth, Marco ;

Felder, Marius ;

Hastie, Alex ;

Simkova, Hana ;

Stankova, Helena ;

Vrana, Jan ;

Chan, Saki ;

Munoz-Amatriain, Maria ;

Ounit, Rachid ;

Wanamaker, Steve ;

Schmutzer, Thomas ;

Aliyeva-Schnorr, Lala ;

Grasso, Stefano ;

Tanskanen, Jaakko ;

Sampath, Dharanya ;

Heavens, Darren ;

Cao, Sujie ;

Chapman, Brett ;

Dai, Fei ;

Han, Yong ;

Li, Hua ;

Li, Xuan ;

Lin, Chongyun ;

McCooke, John K. ;

Tan, Cong ;

Wang, Songbo ;

Yin, Shuya ;

Zhou, Gaofeng ;

Poland, Jesse A. ;

Bellgard, Matthew I. ;

Houben, Andreas ;

Dolezel, Jaroslav ;

Ayling, Sarah ;

Lonardi, Stefano ;

Langridge, Peter ;

Muehlbauer, Gary J. ;

Kersey, Paul ;

Clark, Matthew D. ;

Caccamo, Mario ;

Schulman, Alan H. .

SCIENTIFIC DATA, 2017, 4

[9] Insights into Land Plant Evolution Garnered from the Marchantia polymorpha Genome [J].

Bowman, John L. ;

Kohchi, Takayuki ;

Yamato, Katsuyuki T. ;

Jenkins, Jerry ;

Shu, Shengqiang ;

Ishizaki, Kimitsune ;

Yamaoka, Shohei ;

Nishihama, Ryuichi ;

Nakamura, Yasukazu ;

Berger, Frederic ;

Adam, Catherine ;

Aki, Shiori Sugamata ;

Althoff, Felix ;

Araki, Takashi ;

Arteaga-Vazquez, Mario A. ;

Balasubrmanian, Sureshkumar ;

Barry, Kerrie ;

Bauer, Diane ;

Boehm, Christian R. ;

Briginshaw, Liam ;

Caballero-Perez, Juan ;

Catarino, Bruno ;

Chen, Feng ;

Chiyoda, Shota ;

Chovatia, Mansi ;

Davies, Kevin M. ;

Delmans, Mihails ;

Demura, Taku ;

Dierschke, Tom ;

Dolan, Liam ;

Dorantes-Acosta, Ana E. ;

Eklund, D. Magnus ;

Florent, Stevie N. ;

Flores-Sandoval, Eduardo ;

Fujiyama, Asao ;

Fukuzawa, Hideya ;

Galik, Bence ;

Grimanelli, Daniel ;

Grimwood, Jane ;

Grossniklaus, Ueli ;

Hamada, Takahiro ;

Haseloff, Jim ;

Hetherington, Alexander J. ;

Higo, Asuka ;

Hirakawa, Yuki ;

Hundley, Hope N. ;

Ikeda, Yoko ;

Inoue, Keisuke ;

Inoue, Shin-Ichiro ;

Ishida, Sakiko .

CELL, 2017, 171 (02) :287-+

[10] Insights into the red algae and eukaryotic evolution from the genome of Porphyra umbilicalis (Bangiophyceae, Rhodophyta) [J].

Brawley, Susan H. ;

Blouin, Nicolas A. ;

Ficko-Blean, Elizabeth ;

Wheeler, Glen L. ;

Lohr, Martin ;

Goodson, Holly V. ;

Jenkins, Jerry W. ;

Blaby-Haas, Crysten E. ;

Helliwell, Katherine E. ;

Chan, Cheong Xin ;

Marriage, Tara N. ;

Bhattacharya, Debashish ;

Klein, Anita S. ;

Badis, Yacine ;

Brodie, Juliet ;

Cao, Yuanyu ;

Collen, Jonas ;

Dittami, Simon M. ;

Gachon, Claire M. M. ;

Green, Beverley R. ;

Karpowicz, Steven J. ;

Kim, Jay W. ;

Kudahl, Ulrich Johan ;

Lin, Senjie ;

Michel, Gurvan ;

Mittag, Maria ;

Olson, Bradley J. S. C. ;

Pangilinan, Jasmyn L. ;

Peng, Yi ;

Qiu, Huan ;

Shu, Shengqiang ;

Singer, John T. ;

Smith, Alison G. ;

Sprecher, Brittany N. ;

Wagner, Volker ;

Wang, Wenfei ;

Wang, Zhi-Yong ;

Yan, Juying ;

Yarish, Charles ;

Zauner-Riek, Simone ;

Zhuang, Yunyun ;

Zou, Yong ;

Lindquist, Erika A. ;

Grimwood, Jane ;

Barry, Kerrie W. ;

Rokhsar, Daniel S. ;

Schmutz, Jeremy ;

Stiller, John W. ;

Grossman, Arthur R. ;

Prochnik, Simon E. .

PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA, 2017, 114 (31) :E6361-E6370

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[1] High-Resolution Linkage Map and Chromosome-Scale Genome Assembly for Cassava (Manihot esculenta Crantz) from 10 Populations [J].

Alaba, Oluwafemi A. ;

Bredeson, Jessen V. ;

Egesi, Chiedozie N. ;

Esuma, Williams ;

Ezenwaka, Lydia ;

Ferguson, Morag E. ;

Ha, Cindy M. ;

Hall, Megan ;

Herselman, Liezel ;

Ikpan, Andrew ;

Kafiriti, Elly ;

Kanju, Edward ;

Kapinga, Fortunus ;

Karugu, Arthur ;

Kawuki, Robert ;

Kimata, Bernadetha ;

Kimurto, Paul ;

Kulakow, Peter ;

Kulembeka, Heneriko ;

Kusolwa, Paul ;

Lyons, Jessica B. ;

Masumba, Esther ;

van de Merwe, Albe ;

Mkamilo, Geoffrey ;

Myburg, Alexander A. ;

Nwaogu, Ahamefule ;

Nzuki, Inosters ;

Olasanmi, Bunmi ;

Okogbenin, Emmanuel ;

Onyegbule, Onyeyirichi ;

Owuoche, James ;

Pariyo, Anthony ;

Prochnik, Simon E. ;

Rabbi, Ismail Y. ;

Rokhsar, Daniel S. ;

Rounsley, Steve ;

Salum, Kasele ;

Shuaibu, Kahya S. ;

Sichalwe, Caroline ;

Stephen, Mary .

G3-GENES GENOMES GENETICS, 2015, 5 (01) :133-144

[2] Transposons played a major role in the diversification between the closely related almond and peach genomes: results from the almond genome sequence [J].

Alioto, Tyler ;

Alexiou, Konstantinos G. ;

Bardil, Amelie ;

Barteri, Fabio ;

Castanera, Raul ;

Cruz, Fernando ;

Dhingra, Amit ;

Duval, Henri ;

Fernandez i Marti, Angel ;

Frias, Leonor ;

Galan, Beatriz ;

Garcia, Jose L. ;

Howad, Werner ;

Gomez-Garrido, Jessica ;

Gut, Marta ;

Julca, Irene ;

Morata, Jordi ;

Puigdomenech, Pere ;

Ribeca, Paolo ;

Rubio Cabetas, Maria J. ;

Vlasova, Anna ;

Wirthensohn, Michelle ;

Garcia-Mas, Jordi ;

Gabaldon, Toni ;

Casacuberta, Josep M. ;

Arus, Pere .

PLANT JOURNAL, 2020, 101 (02) :455-472

[3] Shifting the limits in wheat research and breeding using a fully annotated reference genome [J].

Appels, Rudi ;

Eversole, Kellye ;

Feuillet, Catherine ;

Keller, Beat ;

Rogers, Jane ;

Stein, Nils ;

Pozniak, Curtis J. ;

Choulet, Frederic ;

Distelfeld, Assaf ;

Poland, Jesse ;

Ronen, Gil ;

Sharpe, Andrew G. ;

Pozniak, Curtis ;

Barad, Omer ;

Baruch, Kobi ;

Keeble-Gagnere, Gabriel ;

Mascher, Martin ;

Ben-Zvi, Gil ;

Josselin, Ambre-Aurore ;

Himmelbach, Axel ;

Balfourier, Francois ;

Gutierrez-Gonzalez, Juan ;

Hayden, Matthew ;

Koh, ChuShin ;

Muehlbauer, Gary ;

Pasam, Raj K. ;

Paux, Etienne ;

Rigault, Philippe ;

Tibbits, Josquin ;

Tiwari, Vijay ;

Spannagl, Manuel ;

Lang, Daniel ;

Gundlach, Heidrun ;

Haberer, Georg ;

Mayer, Klaus F. X. ;

Ormanbekova, Danara ;

Prade, Verena ;

Simkova, Hana ;

Wicker, Thomas ;

Swarbreck, David ;

Rimbert, Helene ;

Felder, Marius ;

Guilhot, Nicolas ;

Kaithakottil, Gemy ;

Keilwagen, Jens ;

Leroy, Philippe ;

Lux, Thomas ;

Twardziok, Sven ;

Venturini, Luca ;

Juhasz, Angela .

SCIENCE, 2018, 361 (6403) :661-+

[4] R-Loop Mediated trans Action of the APOLO Long Noncoding RNA [J].

Ariel, Federico ;

Lucero, Leandro ;

Christ, Aurelie ;

Mammarella, Maria Florencia ;

Jegu, Teddy ;

Veluchamy, Alaguraj ;

Mariappan, Kiruthiga ;

Latrasse, David ;

Blein, Thomas ;

Liu, Chang ;

Benhamed, Moussa ;

Crespi, Martin .

MOLECULAR CELL, 2020, 77 (05) :1055-+

[5] Wild emmer genome architecture and diversity elucidate wheat evolution and domestication [J].

Avni, Raz ;

Nave, Moran ;

Barad, Omer ;

Baruch, Kobi ;

Twardziok, Sven O. ;

Gundlach, Heidrun ;

Hale, Iago ;

Mascher, Martin ;

Spannagl, Manuel ;

Wiebe, Krystalee ;

Jordan, Katherine W. ;

Golan, Guy ;

Deek, Jasline ;

Ben-Zvi, Batsheva ;

Ben-Zvi, Gil ;

Himmelbach, Axel ;

MacLachlan, Ron P. ;

Sharpe, Andrew G. ;

Fritz, Allan ;

Ben-David, Roi ;

Budak, Hikmet ;

Fahima, Tzion ;

Korol, Abraham ;

Faris, Justin D. ;

Hernandez, Alvaro ;

Mikel, Mark A. ;

Levy, Avraham A. ;

Steffenson, Brian ;

Maccaferri, Marco ;

Tuberosa, Roberto ;

Cattivelli, Luigi ;

Faccioli, Primetta ;

Ceriotti, Aldo ;

Kashkush, Khalil ;

Pourkheirandish, Mohammad ;

Komatsuda, Takao ;

Eilam, Tamar ;

Sela, Hanan ;

Sharon, Amir ;

Ohad, Nir ;

Chamovitz, Daniel A. ;

Mayer, Klaus F. X. ;

Stein, Nils ;

Ronen, Gil ;

Peleg, Zvi ;

Pozniak, Curtis J. ;

Akhunov, Eduard D. ;

Distelfeld, Assaf .

SCIENCE, 2017, 357 (6346) :93-96

[6] The sunflower genome provides insights into oil metabolism, flowering and Asterid evolution [J].

Badouin, Helene ;

Gouzy, Jerome ;

Grassa, Christopher J. ;

Murat, Florent ;

Staton, S. Evan ;

Cottret, Ludovic ;

Lelandais-Briere, Christine ;

Owens, Gregory L. ;

Carrere, Sebastien ;

Mayjonade, Baptiste ;

Legrand, Ludovic ;

Gill, Navdeep ;

Kane, Nolan C. ;

Bowers, John E. ;

Hubner, Sariel ;

Bellec, Arnaud ;

Berard, Aurelie ;

Berges, Helene ;

Blanchet, Nicolas ;

Boniface, Marie-Claude ;

Brunel, Dominique ;

Catrice, Olivier ;

Chaidir, Nadia ;

Claudel, Clotilde ;

Donnadieu, Cecile ;

Faraut, Thomas ;

Fievet, Ghislain ;

Helmstetter, Nicolas ;

King, Matthew ;

Knapp, Steven J. ;

Lai, Zhao ;

Le Paslier, Marie-Christine ;

Lippi, Yannick ;

Lorenzon, Lolita ;

Mandel, Jennifer R. ;

Marage, Gwenola ;

Marchand, Gwenaelle ;

Marquand, Elodie ;

Bret-Mestries, Emmanuelle ;

Morien, Evan ;

Nambeesan, Savithri ;

Thuy Nguyen ;

Pegot-Espagnet, Prune ;

Pouilly, Nicolas ;

Raftis, Frances ;

Sallet, Erika ;

Schiex, Thomas ;

Thomas, Justine ;

Vandecasteele, Celine ;

Vares, Didier .

NATURE, 2017, 546 (7656) :148-+

[7] Repbase Update, a database of repetitive elements in eukaryotic genomes [J].

Bao, Weidong ;

Kojima, Kenji K. ;

Kohany, Oleksiy .

MOBILE DNA, 2015, 6

[8] Construction of a map-based reference genome sequence for barley, Hordeum vulgare L. [J].

Beier, Sebastian ;

Himmelbach, Axel ;

Colmsee, Christian ;

Zhang, Xiao-Qi ;

Barrero, Roberto A. ;

Zhang, Qisen ;

Li, Lin ;

Bayer, Micha ;

Bolser, Daniel ;

Taudien, Stefan ;

Groth, Marco ;

Felder, Marius ;

Hastie, Alex ;

Simkova, Hana ;

Stankova, Helena ;

Vrana, Jan ;

Chan, Saki ;

Munoz-Amatriain, Maria ;

Ounit, Rachid ;

Wanamaker, Steve ;

Schmutzer, Thomas ;

Aliyeva-Schnorr, Lala ;

Grasso, Stefano ;

Tanskanen, Jaakko ;

Sampath, Dharanya ;

Heavens, Darren ;

Cao, Sujie ;

Chapman, Brett ;

Dai, Fei ;

Han, Yong ;

Li, Hua ;

Li, Xuan ;

Lin, Chongyun ;

McCooke, John K. ;

Tan, Cong ;

Wang, Songbo ;

Yin, Shuya ;

Zhou, Gaofeng ;

Poland, Jesse A. ;

Bellgard, Matthew I. ;

Houben, Andreas ;

Dolezel, Jaroslav ;

Ayling, Sarah ;

Lonardi, Stefano ;

Langridge, Peter ;

Muehlbauer, Gary J. ;

Kersey, Paul ;

Clark, Matthew D. ;

Caccamo, Mario ;

Schulman, Alan H. .

SCIENTIFIC DATA, 2017, 4

[9] Insights into Land Plant Evolution Garnered from the Marchantia polymorpha Genome [J].

Bowman, John L. ;

Kohchi, Takayuki ;

Yamato, Katsuyuki T. ;

Jenkins, Jerry ;

Shu, Shengqiang ;

Ishizaki, Kimitsune ;

Yamaoka, Shohei ;

Nishihama, Ryuichi ;

Nakamura, Yasukazu ;

Berger, Frederic ;

Adam, Catherine ;

Aki, Shiori Sugamata ;

Althoff, Felix ;

Araki, Takashi ;

Arteaga-Vazquez, Mario A. ;

Balasubrmanian, Sureshkumar ;

Barry, Kerrie ;

Bauer, Diane ;

Boehm, Christian R. ;

Briginshaw, Liam ;

Caballero-Perez, Juan ;

Catarino, Bruno ;

Chen, Feng ;

Chiyoda, Shota ;

Chovatia, Mansi ;

Davies, Kevin M. ;

Delmans, Mihails ;

Demura, Taku ;

Dierschke, Tom ;

Dolan, Liam ;

Dorantes-Acosta, Ana E. ;

Eklund, D. Magnus ;

Florent, Stevie N. ;

Flores-Sandoval, Eduardo ;

Fujiyama, Asao ;

Fukuzawa, Hideya ;

Galik, Bence ;

Grimanelli, Daniel ;

Grimwood, Jane ;

Grossniklaus, Ueli ;

Hamada, Takahiro ;

Haseloff, Jim ;

Hetherington, Alexander J. ;

Higo, Asuka ;

Hirakawa, Yuki ;

Hundley, Hope N. ;

Ikeda, Yoko ;

Inoue, Keisuke ;

Inoue, Shin-Ichiro ;

Ishida, Sakiko .

CELL, 2017, 171 (02) :287-+

[10] Insights into the red algae and eukaryotic evolution from the genome of Porphyra umbilicalis (Bangiophyceae, Rhodophyta) [J].

Brawley, Susan H. ;

Blouin, Nicolas A. ;

Ficko-Blean, Elizabeth ;

Wheeler, Glen L. ;

Lohr, Martin ;

Goodson, Holly V. ;

Jenkins, Jerry W. ;

Blaby-Haas, Crysten E. ;

Helliwell, Katherine E. ;

Chan, Cheong Xin ;

Marriage, Tara N. ;

Bhattacharya, Debashish ;

Klein, Anita S. ;

Badis, Yacine ;

Brodie, Juliet ;

Cao, Yuanyu ;

Collen, Jonas ;

Dittami, Simon M. ;

Gachon, Claire M. M. ;

Green, Beverley R. ;

Karpowicz, Steven J. ;

Kim, Jay W. ;

Kudahl, Ulrich Johan ;

Lin, Senjie ;

Michel, Gurvan ;

Mittag, Maria ;

Olson, Bradley J. S. C. ;

Pangilinan, Jasmyn L. ;

Peng, Yi ;

Qiu, Huan ;

Shu, Shengqiang ;

Singer, John T. ;

Smith, Alison G. ;

Sprecher, Brittany N. ;

Wagner, Volker ;

Wang, Wenfei ;

Wang, Zhi-Yong ;

Yan, Juying ;

Yarish, Charles ;

Zauner-Riek, Simone ;

Zhuang, Yunyun ;

Zou, Yong ;

Lindquist, Erika A. ;

Grimwood, Jane ;

Barry, Kerrie W. ;

Rokhsar, Daniel S. ;

Schmutz, Jeremy ;

Stiller, John W. ;

Grossman, Arthur R. ;

Prochnik, Simon E. .

PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA, 2017, 114 (31) :E6361-E6370

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