Accessible, curated metagenomic data through ExperimentHub

被引：292

作者：

Pasolli, Edoardo ^{[1
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Schiffer, Lucas ^{[2
,3
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Manghi, Paolo ^{[1
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Renson, Audrey ^{[2
,3
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Obenchain, Valerie ^{[3
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Duy Tin Truong ^{[1
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Beghini, Francesco ^{[1
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Malik, Faizan ^{[2
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Ramos, Marcel ^{[2
,3
,4
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Dowd, Jennifer B. ^{[2
,5
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Huttenhower, Curtis ^{[6
,7
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Morgan, Martin ^{[4
]}

Segata, Nicola ^{[1
]}

Waldron, Levi ^{[2
,3
]}

机构：

[1] Univ Trento, Ctr Integrat Biol, Trento, Italy

[2] CUNY, Grad Sch Publ Hlth & Hlth Policy, New York, NY 10021 USA

[3] CUNY, Inst Implementat Sci & Populat Hlth, New York, NY 10021 USA

[4] SUNY Buffalo, Roswell Pk Canc Inst, Buffalo, NY USA

[5] Kings Coll London, Dept Global Hlth & Social Med, London, England

[6] Harvard Sch Publ Hlth, Biostat Dept, Boston, MA USA

[7] Broad Inst, Cambridge, MA USA

来源：

NATURE METHODS | 2017年 / 14卷 / 11期

基金：

欧洲研究理事会; 美国国家科学基金会;

关键词：

MICROBIOME;

D O I：

10.1038/nmeth.4468

中图分类号：

Q5 [生物化学];

学科分类号：

071010 ; 081704 ;

摘要：

引用

页码：1023 / 1024

页数：2

共 6 条

[1] Metabolic Reconstruction for Metagenomic Data and Its Application to the Human Microbiome [J].

Abubucker, Sahar ;

Segata, Nicola ;

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Thiagarajan, Mathangi ;

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Batto, Jean-Michel ;

Bertalan, Marcelo ;

Borruel, Natalia ;

Casellas, Francesc ;

Fernandez, Leyden ;

Gautier, Laurent ;

Hansen, Torben ;

Hattori, Masahira ;

Hayashi, Tetsuya ;

Kleerebezem, Michiel ;

Kurokawa, Ken ;

Leclerc, Marion ;

Levenez, Florence ;

Manichanh, Chaysavanh ;

Nielsen, H. Bjorn ;

Nielsen, Trine ;

Pons, Nicolas ;

Poulain, Julie ;

Qin, Junjie ;

Sicheritz-Ponten, Thomas ;

Tims, Sebastian ;

Torrents, David ;

Ugarte, Edgardo ;

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Mitreva, Makedonka ;

Muzny, Donna M. ;

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Versalovic, James ;

Wollam, Aye M. ;

Worley, Kim C. ;

Wortman, Jennifer R. ;

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Zeng, Qiandong ;

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Abolude, Olukemi O. ;

Allen-Vercoe, Emma ;

Alm, Eric J. ;

Alvarado, Lucia ;

Andersen, Gary L. ;

Anderson, Scott ;

Appelbaum, Elizabeth ;

Arachchi, Harindra M. ;

Armitage, Gary ;

Arze, Cesar A. ;

Ayvaz, Tulin ;

Baker, Carl C. ;

Begg, Lisa ;

Belachew, Tsegahiwot ;

Bhonagiri, Veena ;

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