Towards an integrative genomics of lung function

被引：0

作者：

Cho, Michael H. ^{[1
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机构：

[1] Brigham & Womens Hosp, Channing Div Network Med, Boston, MA 02115 USA

[2] Brigham & Womens Hosp, Div Pulm & Crit Care Med, Boston, MA 02115 USA

来源：

LANCET RESPIRATORY MEDICINE | 2015年 / 3卷 / 10期

关键词：

EXPRESSION; VARIANTS; HUMANS; LOCI;

D O I：

10.1016/S2213-2600(15)00362-8

中图分类号：

R4 [临床医学];

学科分类号：

1002 ; 100602 ;

摘要：

引用

页码：739 / 741

页数：4

共 10 条

[1] The Genotype-Tissue Expression (GTEx) pilot analysis: Multitissue gene regulation in humans [J].

Ardlie, Kristin G. ;

DeLuca, David S. ;

Segre, Ayellet V. ;

Sullivan, Timothy J. ;

Young, Taylor R. ;

Gelfand, Ellen T. ;

Trowbridge, Casandra A. ;

Maller, Julian B. ;

Tukiainen, Taru ;

Lek, Monkol ;

Ward, Lucas D. ;

Kheradpour, Pouya ;

Iriarte, Benjamin ;

Meng, Yan ;

Palmer, Cameron D. ;

Esko, Tonu ;

Winckler, Wendy ;

Hirschhorn, Joel N. ;

Kellis, Manolis ;

MacArthur, Daniel G. ;

Getz, Gad ;

Shabalin, Andrey A. ;

Li, Gen ;

Zhou, Yi-Hui ;

Nobel, Andrew B. ;

Rusyn, Ivan ;

Wright, Fred A. ;

Lappalainen, Tuuli ;

Ferreira, Pedro G. ;

Ongen, Halit ;

Rivas, Manuel A. ;

Battle, Alexis ;

Mostafavi, Sara ;

Monlong, Jean ;

Sammeth, Michael ;

Mele, Marta ;

Reverter, Ferran ;

Goldmann, Jakob M. ;

Koller, Daphne ;

Guigo, Roderic ;

McCarthy, Mark I. ;

Dermitzakis, Emmanouil T. ;

Gamazon, Eric R. ;

Im, Hae Kyung ;

Konkashbaev, Anuar ;

Nicolae, Dan L. ;

Cox, Nancy J. ;

Flutre, Timothee ;

Wen, Xiaoquan ;

Stephens, Matthew .

SCIENCE, 2015, 348 (6235) :648-660

[2] Genetic control of gene expression at novel and established chronic obstructive pulmonary disease loci [J].

Castaldi, Peter J. ;

Cho, Michael H. ;

Zhou, Xiaobo ;

Qiu, Weiliang ;

Mcgeachie, Michael ;

Celli, Bartolome ;

Bakke, Per ;

Gulsvik, Amund ;

Lomas, David A. ;

Crapo, James D. ;

Beaty, Terri H. ;

Rennard, Stephen ;

Harshfield, Benjamin ;

Lange, Christoph ;

Singh, Dave ;

Tal-Singer, Ruth ;

Riley, John H. ;

Quackenbush, John ;

Raby, Benjamin A. ;

Carey, Vincent J. ;

Silverman, Edwin K. ;

Hersh, Craig P. .

HUMAN MOLECULAR GENETICS, 2015, 24 (04) :1200-1210

[3] Transcriptome and genome sequencing uncovers functional variation in humans [J].

Lappalainen, Tuuli ;

Sammeth, Michael ;

Friedlaender, Marc R. ;

't Hoen, Peter A. C. ;

Monlong, Jean ;

Rivas, Manuel A. ;

Gonzalez-Porta, Mar ;

Kurbatova, Natalja ;

Griebel, Thasso ;

Ferreira, Pedro G. ;

Barann, Matthias ;

Wieland, Thomas ;

Greger, Liliana ;

van Iterson, Maarten ;

Almloef, Jonas ;

Ribeca, Paolo ;

Pulyakhina, Irina ;

Esser, Daniela ;

Giger, Thomas ;

Tikhonov, Andrew ;

Sultan, Marc ;

Bertier, Gabrielle ;

MacArthur, Daniel G. ;

Lek, Monkol ;

Lizano, Esther ;

Buermans, Henk P. J. ;

Padioleau, Ismael ;

Schwarzmayr, Thomas ;

Karlberg, Olof ;

Ongen, Halit ;

Kilpinen, Helena ;

Beltran, Sergi ;

Gut, Marta ;

Kahlem, Katja ;

Amstislavskiy, Vyacheslav ;

Stegle, Oliver ;

Pirinen, Matti ;

Montgomery, Stephen B. ;

Donnelly, Peter ;

McCarthy, Mark I. ;

Flicek, Paul ;

Strom, Tim M. ;

Lehrach, Hans ;

Schreiber, Stefan ;

Sudbrak, Ralf ;

Carracedo, Angel ;

Antonarakis, Stylianos E. ;

Haesler, Robert ;

Syvaenen, Ann-Christine ;

Van Ommen, Gert-Jan .

NATURE, 2013, 501 (7468) :506-511

[4] Genetic variants regulating ORMDL3 expression contribute to the risk of childhood asthma [J].

Moffatt, Miriam F. ;

Kabesch, Michael ;

Liang, Liming ;

Dixon, Anna L. ;

Strachan, David ;

Heath, Simon ;

Depner, Martin ;

von Berg, Andrea ;

Bufe, Albrecht ;

Rietschel, Ernst ;

Heinzmann, Andrea ;

Simma, Burkard ;

Frischer, Thomas ;

Willis-Owen, Saffron A. G. ;

Wong, Kenny C. C. ;

Illig, Thomas ;

Vogelberg, Christian ;

Weiland, Stephan K. ;

von Mutius, Erika ;

Abecasis, Goncalo R. ;

Farrall, Martin ;

Gut, Ivo G. ;

Lathrop, G. Mark ;

Cookson, William O. C. .

NATURE, 2007, 448 (7152) :470-U5

[5] Trait-Associated SNPs Are More Likely to Be eQTLs: Annotation to Enhance Discovery from GWAS [J].

Nicolae, Dan L. ;

Gamazon, Eric ;

Zhang, Wei ;

Duan, Shiwei ;

Dolan, M. Eileen ;

Cox, Nancy J. .

PLOS GENETICS, 2010, 6 (04)

[6] Molecular mechanisms underlying variations in lung function: a systems genetics analysis [J].

Obeidat, Ma'en ;

Hao, Ke ;

Bosse, Yohan ;

Nickle, David C. ;

Nie, Yunlong ;

Postma, Dirkje S. ;

Laviolette, Michel ;

Sandford, Andrew J. ;

Daley, Denise D. ;

Hogg, James C. ;

Elliott, W. Mark ;

Fishbane, Nick ;

Timens, Wim ;

Hysi, Pirro G. ;

Kaprio, Jaakko ;

Wilson, James F. ;

Hui, Jennie ;

Rawal, Rajesh ;

Schulz, Holger ;

Stubbe, Beate ;

Hayward, Caroline ;

Polasek, Ozren ;

Jarvelin, Marjo-Riitta ;

Zhao, Jing Hua ;

Jarvis, Deborah ;

Kahonen, Mika ;

Franceschini, Nora ;

North, Kari E. ;

Loth, Daan W. ;

Brusselle, Guy G. ;

Smith, Albert Vernon ;

Gudnason, Vilmundur ;

Bartz, Traci M. ;

Wilk, Jemma B. ;

O'Connor, George T. ;

Cassano, Patricia A. ;

Tang, Wenbo ;

Wain, Louise V. ;

Artigas, Maria Soler ;

Gharib, Sina A. ;

Strachan, David P. ;

Sin, Don D. ;

Tobin, Martin D. ;

London, Stephanie J. ;

Hall, Ian P. ;

Pare, Peter D. .

LANCET RESPIRATORY MEDICINE, 2015, 3 (10) :782-795

[7] Biological insights from 108 schizophrenia-associated genetic loci [J].

Ripke, Stephan ;

Neale, Benjamin M. ;

Corvin, Aiden ;

Walters, James T. R. ;

Farh, Kai-How ;

Holmans, Peter A. ;

Lee, Phil ;

Bulik-Sullivan, Brendan ;

Collier, David A. ;

Huang, Hailiang ;

Pers, Tune H. ;

Agartz, Ingrid ;

Agerbo, Esben ;

Albus, Margot ;

Alexander, Madeline ;

Amin, Farooq ;

Bacanu, Silviu A. ;

Begemann, Martin ;

Belliveau, Richard A., Jr. ;

Bene, Judit ;

Bergen, Sarah E. ;

Bevilacqua, Elizabeth ;

Bigdeli, Tim B. ;

Black, Donald W. ;

Bruggeman, Richard ;

Buccola, Nancy G. ;

Buckner, Randy L. ;

Byerley, William ;

Cahn, Wiepke ;

Cai, Guiqing ;

Campion, Dominique ;

Cantor, Rita M. ;

Carr, Vaughan J. ;

Carrera, Noa ;

Catts, Stanley V. ;

Chambert, Kimberly D. ;

Chan, Raymond C. K. ;

Chen, Ronald Y. L. ;

Chen, Eric Y. H. ;

Cheng, Wei ;

Cheung, Eric F. C. ;

Chong, Siow Ann ;

Cloninger, C. Robert ;

Cohen, David ;

Cohen, Nadine ;

Cormican, Paul ;

Craddock, Nick ;

Crowley, James J. ;

Curtis, David ;

Davidson, Michael .

NATURE, 2014, 511 (7510) :421-+

[8] Obesity-associated variants within FTO form long-range functional connections with IRX3 [J].

Smemo, Scott ;

Tena, Juan J. ;

Kim, Kyoung-Han ;

Gamazon, Eric R. ;

Sakabe, Noboru J. ;

Gomez-Marin, Carlos ;

Aneas, Ivy ;

Credidio, Flavia L. ;

Sobreira, Debora R. ;

Wasserman, Nora F. ;

Lee, Ju Hee ;

Puviindran, Vijitha ;

Tam, Davis ;

Shen, Michael ;

Son, Joe Eun ;

Vakili, Niki Alizadeh ;

Sung, Hoon-Ki ;

Naranjo, Silvia ;

Acemel, Rafael D. ;

Manzanares, Miguel ;

Nagy, Andras ;

Cox, Nancy J. ;

Hui, Chi-Chung ;

Luis Gomez-Skarmeta, Jose ;

Nobrega, Marcelo A. .

NATURE, 2014, 507 (7492) :371-+

[9] Allele-Specific Chromatin Remodeling in the ZPBP2/GSDMB/ORMDL3 Locus Associated with the Risk of Asthma and Autoimmune Disease [J].

Verlaan, Dominique J. ;

Berlivet, Soizik ;

Hunninghake, Gary M. ;

Madore, Anne-Marie ;

Lariviere, Mathieu ;

Moussette, Sanny ;

Grundberg, Elin ;

Kwan, Tony ;

Ouimet, Manon ;

Ge, Bing ;

Hoberman, Rose ;

Swiatek, Marcin ;

Dias, Joana ;

Lam, Kevin C. L. ;

Koka, Vonda ;

Harmsen, Eef ;

Soto-Quiros, Manuel ;

Avila, Lydiana ;

Celedon, Juan C. ;

Weiss, Scott T. ;

Dewar, Ken ;

Sinnett, Daniel ;

Laprise, Catherine ;

Raby, Benjamin A. ;

Pastinen, Tomi ;

Naumova, Anna K. .

AMERICAN JOURNAL OF HUMAN GENETICS, 2009, 85 (03) :377-393

[10] Five Years of GWAS Discovery [J].

Visscher, Peter M. ;

Brown, Matthew A. ;

McCarthy, Mark I. ;

Yang, Jian .

AMERICAN JOURNAL OF HUMAN GENETICS, 2012, 90 (01) :7-24

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