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7种作物叶绿体基因的密码子偏好性及聚类分析附视频
被引:29
作者:

晁岳恩
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常阳
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王美芳
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何盛莲
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雷振生
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[1] 河南省农业科学院小麦研究中心,河南省小麦生物学重点实验室
来源:
关键词:
作物;
叶绿体基因;
密码子偏好性;
聚类分析;
D O I:
暂无
中图分类号:
S33 [作物遗传育种与良种繁育];
学科分类号:
071007 ;
090102 ;
摘要:
研究作物叶绿体蛋白编码基因的编码特点,对指导农作物的叶绿体基因工程研究设计,促进外源基因在受体作物中的高效、稳定表达具有重要作用。为此,综合运用了多种分析软件,对7种大田作物的叶绿体蛋白编码基因进行分析。结果表明:叶绿体蛋白编码基因的总碱基构成在7种作物中差异不大,都是A含量最高,而G,C的含量较低;但在密码子第3位的碱基构成上却有明显差别,3种双子叶作物偏爱以C,T结尾的密码子,而禾本科的4种作物则偏爱以T,C结尾的密码子;RSCU(同义密码子的相对使用度)值显示出禾本科作物有26个密码子具有偏好性,而双子叶作物有25个密码子具有偏好性,但二者之间有22个相同的偏好性密码子。基于RSCU值的聚类结果显示,植物的密码子偏好性具有种族特征,表明基于叶绿体蛋白编码基因的密码子使用特性的聚类结果可以作为系统发育分析的重要补充。
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李祥龙
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常重杰
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河南师范大学生命科学学院 中州大学化工食品学院

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强承魁
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徐州生物工程职业技术学院农林工程系 徐州生物工程职业技术学院农林工程系

王胜永
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徐州生物工程职业技术学院农林工程系 徐州生物工程职业技术学院农林工程系

凤舞剑
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徐州生物工程职业技术学院农林工程系 徐州生物工程职业技术学院农林工程系

于玲雅
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山东省植物保护总站 徐州生物工程职业技术学院农林工程系

秦越华
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西南民族大学动物遗传育种学国家民委-教育部共建重点实验室 西南民族大学动物遗传育种学国家民委-教育部共建重点实验室

钟金城
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西南民族大学动物遗传育种学国家民委-教育部共建重点实验室 西南民族大学动物遗传育种学国家民委-教育部共建重点实验室

杨万远
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西南民族大学动物遗传育种学国家民委-教育部共建重点实验室 西南民族大学动物遗传育种学国家民委-教育部共建重点实验室

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穆松
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西南民族大学动物遗传育种学国家民委-教育部共建重点实验室 西南民族大学动物遗传育种学国家民委-教育部共建重点实验室

姬秋梅
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西藏农业科学院畜牧兽医研究所 西南民族大学动物遗传育种学国家民委-教育部共建重点实验室

张成福
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西藏农业科学院畜牧兽医研究所 西南民族大学动物遗传育种学国家民委-教育部共建重点实验室
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张怀渝
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陈必链
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机构: 福建师范大学工业微生物教育部工程研究中心生命科学学院

王明兹
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周晓明
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赵慧芳
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陆嘉良
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潘浩
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徐眉
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机构: 复旦大学公共卫生学院

赵根明
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姜庆五
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机构: 复旦大学公共卫生学院

汪华
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机构: 复旦大学公共卫生学院

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Univ Cent Florida, Dept Mol Biol & Microbiol, Orlando, FL 32816 USA Univ Cent Florida, Dept Mol Biol & Microbiol, Orlando, FL 32816 USA

Daniell, H
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机构: Chinese Acad Sci, Inst Genet, Beijing 100101, Peoples R China

Wan, LH
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机构: Chinese Acad Sci, Inst Genet, Beijing 100101, Peoples R China

Zhang, ZL
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机构: Chinese Acad Sci, Inst Genet, Beijing 100101, Peoples R China

Shen, GF
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