苹果全基因组PIN成员鉴定及MdPIN15的克隆和在腋芽萌发中的表达分析

被引:6
作者
刘小杰
樊胜
李国防
檀鸣
默宁
马娟娟
张东
韩明玉
机构
[1] 西北农林科技大学园艺学院
关键词
苹果; PIN; 腋芽萌发; 生物信息学; 基因表达;
D O I
10.16420/j.issn.0513-353x.2017-0219
中图分类号
S661.1 [苹果];
学科分类号
090201 ;
摘要
从苹果金冠基因组中鉴定得到18个生长素输出载体蛋白PIN-formed(PIN),对其进行理化特性、基因结构、系统进化和启动子元件分析。结果表明,MdPIN基因家族中,含有1~14个外显子,0~13个内含子;MdPIN蛋白的保守基序数量在3~10。苹果PIN和拟南芥PIN等蛋白高度同源,且根据其进化树分为G1、G2和G3亚组;18个MdPIN在不同基因型苹果的不同器官中表达具有明显差异。以‘长富2号’为材料,从其腋芽中克隆得到一个候选基因MdPIN15,其开放阅读框为1869 bp,编码622个氨基酸。实时定量PCR表明,MdPIN15在梢尖部位表达量最高,其次是腋芽,在花芽中表达量最低;,外源GR24和Lovastatin(LVS)处理降低MdPIN15的表达量;6-BA和去茎尖处理提高了MdPIN15的表达量。MdPIN15在介导细胞分裂素(CK)、生长素(IAA)和独脚金内酯(SL)等激素调控腋芽萌发有重要作用。
引用
收藏
页码:2041 / 2054
页数:14
相关论文
共 27 条
[1]  
Molecular cloning and functional characterization of MdPIN1 in apple[J]. AN Jian-ping,LIU Xin,LI Hao-hao,YOU Chun-xiang,SHU Jing,WANG Xiao-fei,HAO Yu-jin.Journal of Integrative Agriculture. 2017(05)
[2]   苹果‘长富2号’开花调控转录因子基因MdSPL6的克隆及表达分析 [J].
樊胜 ;
张岚清 ;
刘柯 ;
雷超 ;
陈欣 ;
姚殿城 ;
张东 ;
韩明玉 .
园艺学报, 2016, 43 (11) :2089-2098
[3]   菠萝生长素极性运输载体基因AcPINs和AcAUXs的分离与表达分析 [J].
李运合 ;
孙光明 ;
张红娜 ;
刘胜辉 ;
吴青松 .
园艺学报, 2016, 43 (10) :1916-1928
[4]   苹果全基因组多聚半乳糖醛酸酶基因家族的鉴定及进化分析 [J].
陈鸿飞 ;
邵红霞 ;
樊胜 ;
马娟娟 ;
张东 ;
韩明玉 .
园艺学报, 2016, 43 (10) :1863-1877
[5]   狗蔷薇生长素输出载体蛋白基因PIN1和PIN2的分离与表达分析 [J].
刘凤栾 ;
寇亚平 ;
陈晓丽 ;
高彬 ;
王玲 ;
赵梁军 .
园艺学报, 2014, 41 (05) :925-934
[6]   植物分枝发育的调控机制 [J].
李亚栋 ;
张芊 ;
孙学辉 ;
路铁刚 .
中国农业科技导报, 2009, 11 (04) :1-9
[7]   Phylogenetic analysis of IDD gene family and characterization of its expression in response to flower induction in Malus [J].
Fan, Sheng ;
Zhang, Dong ;
Xing, Libo ;
Qi, Siyan ;
Du, Lisha ;
Wu, Haiqin ;
Shao, Hongxia ;
Li, Youmei ;
Ma, Juanjuan ;
Han, Mingyu .
MOLECULAR GENETICS AND GENOMICS, 2017, 292 (04) :755-771
[8]   Analysis of Nicotiana tabacum PIN genes identifies NtPIN4 as a key regulator of axillary bud growth [J].
Xie, Xiaodong ;
Qin, Guangyong ;
Si, Ping ;
Luo, Zhaopeng ;
Gao, Junping ;
Chen, Xia ;
Zhang, Jianfeng ;
Wei, Pan ;
Xia, Qingyou ;
Lin, Fucheng ;
Yang, Jun .
PHYSIOLOGIA PLANTARUM, 2017, 160 (02) :222-239
[9]  
Auxin regulation of cell polarity in plants[J] . Xue Pan,Jisheng Chen,Zhenbiao Yang.Current Opinion in Plant Biology . 2015
[10]   Origin and evolution of PIN auxin transporters in the green lineage [J].
Viaene, Tom ;
Delwiche, Charles F. ;
Rensing, Stefan A. ;
Friml, Jiri .
TRENDS IN PLANT SCIENCE, 2013, 18 (01) :5-10