水稻干旱胁迫诱导DNA甲基化时空变化特征分析

被引：75

作者：

潘雅姣 ^{[1
]}

傅彬英 ^{[1
]}

王迪 ^{[1
]}

朱苓华 ^{[1
]}

黎志康 ^{[1
,2
]}

机构：

[1] 中国农业科学院作物科学研究所/国家农作物基因资源和遗传改良重大科学工程

[2] International Rice Research Institute

来源：

中国农业科学 | 2009年 / 09期

关键词：

DNA甲基化; 干旱胁迫; 甲基化敏感扩增多态性; 高效液相层析;

D O I：

暂无

中图分类号：

S511 [稻];

学科分类号：

0901 ;

摘要：

【目的】研究水稻抗旱导入系DK106和旱敏感轮回亲本IR64苗期和分蘖期干旱胁迫前后DNA甲基化的变化情况,并比较分析叶片和根部DNA甲基化变化特征,探讨DNA甲基化在水稻干旱胁迫反应中的作用。【方法】用甲基化敏感扩增多态性技术(methylation sensitive amplified polymorphism,MSAP)和高效液相层析(high performance liquid chromatography,HPLC)方法分析DNA甲基化变化情况;从聚丙烯酰胺凝胶回收甲基化多态性片段并克隆测序及序列比对。【结果】MSAP分析结果显示,水稻基因组中约有20%的CCGG位点发生了胞嘧啶甲基化;水分胁迫导致DNA甲基化平均水平明显增加,其中根部增加幅度尤为明显;DNA甲基化水平及状态变化在品种间存在差异,同时具有时期及组织特异性。对干旱胁迫特异诱导DNA甲基化片段序列分析结果表明,基因编码区和非编码区发生DNA甲基化的频率基本相同。【结论】干旱胁迫反应过程中DNA甲基化表现出一定时空特异性和品种特异性,且与品种抗旱性差异相关。

引用

页码：3009 / 3018

页数：10

共 15 条

[1] 水稻基因组DNA胞嘧啶甲基化在单倍体和对应二倍体间的差异 [J].

张红宇 ;

彭海 ;

李云 ;

徐培洲 ;

汪旭东 ;

吴先军 .

科学通报, 2006, (13) :1529-1535

[2] 油菜种子萌发过程中DNA甲基化的MSAP分析 [J].

陆光远 ;

伍晓明 ;

陈碧云 ;

高桂珍 ;

许鲲 ;

李响枝 .

科学通报 , 2005, (24) :2750-2756

[3] 水稻冷胁迫诱导的甲基化差异片段CIDM7的分离和分析 [J].

华扬 ;

陈学峰 ;

熊建华 ;

张义平 ;

朱英国 .

遗传, 2005, (04) :595-600

[4]

Abscisic Acid‐mediated Epigenetic Processes in Plant Development and Stress Responses[J] . ViswanathanChinnusamy,ZhizhongGong,Jian‐KangZhu.Journal of Integrative Plant Biology . 2008 (10)

[5] Abiotic-stress induces demethylation and transcriptional activation of a gene encoding a glycerophosphodiesterase-like protein in tobacco plants [J].