Vif-APO相关的HIV-1病毒模型

被引：0
|
作者：
王懿 [1 ,2 ]
来鲁华 [1 ,3 ]
机构：
[1] 不详
[2] 北京大学理论生物学中心
[3] 不详
[4] 北京大学物理学院
[5] 北京分子科学国家实验室,分子动态与稳态结构国家重点实验室,北京大学化学与分子工程学院
[6] 不详
来源：
科学通报 | 2010年 / 14期
关键词：
生化网络模型; 病毒宿主相互关系; HIV-1病毒; Vif; APO; Gag; Tat;
D O I：
暂无
中图分类号：
R-332 [医用实验动物学];
学科分类号：
摘要：
病毒感染因子Vif对控制HIV-1病毒的感染能力非常重要,它通过和细胞抗病毒蛋白APOBEC家族(简写成APO)的相互作用,引发APO的快速降解从而阻止APO被包装到新生的病毒粒子中.在本论文中,我们提出一个数学模型来定量地描述这种典型的病毒-宿主相互作用.为检验该模型,我们将计算模拟结果和4组已发表的实验数据进行了对比.在此基础上进行了系统的参数敏感性分析和扰动分析,表明与APO相关的参数对于新生HIV-1病毒粒子的感染能力非常重要.我们发现病毒结构蛋白Gag的生成速率以及单位新生病毒粒子所需的Gag蛋白分子数目呈现出对高病毒粒子产生速率和低APO包装入新生病毒粒子程度的优化现象,并且模型中的许多参数只在较小的取值范围内对病毒才是有益的.我们还发现针对激活病毒RNA合成的调控蛋白Tat的小扰动会导致Vif和APO包装入新生病毒粒子的量呈现开关效应.这些发现将有助于理解HIV-1病毒的高突变率和潜伏现象,并为药物设计定位关键的靶标提供帮助.
引用
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页码：1310 / 1321
页数：12
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