毛果杨Eukaryotic translation initiation factor 5A(eIF5A)同源基因的生物信息学分析

被引：4

作者：

邵龙婷

郑唐春

臧丽娜

李爽

曲冠证

机构：

[1] 东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室

来源：

安徽农业大学学报 | 2014年 / 41卷 / 01期

关键词：

毛果杨; eIF5A; 生物信息学;

D O I：

10.13610/j.cnki.1672-352x.2014.01.022

中图分类号：

S792.11 [杨];

学科分类号：

摘要：

为研究毛果杨eIF5A基因间的同源性及其进化关系,以毛果杨的eIF5A基因为研究对象,利用生物信息学软件及网站对其进行碱基分布、氨基酸组成、亲疏水性、保守区以及二级结构和三级结构的预测与分析,并与其他物种的eIF5A氨基酸序列进行多重比对与进化分析。结果表明,4个毛果杨eIF5A基因定位于不同染色体上,且都只含有5个外显子;研究还发现不同成员间氨基酸数目、氨基酸序列间的疏水性存在一定的差异;亚细胞定位分析表明,4个eIF5A蛋白均定位于细胞质上;二级结构预测结果显示,4个eIF5A氨基酸序列以无规则卷曲、扩展链和α-螺旋为主要组成部分,且4条氨基酸序列三维结构十分相似。上述结果均为毛果杨eIF5A基因家族的进一步功能分析提供了一定基础。

引用

页码：141 / 149

页数：9

共 9 条

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