16S rRNA基因测序技术分析肝阳上亢型脑出血患者的肠道菌群结构

被引:15
作者
李裕思 [1 ]
许华冲 [2 ]
王俊月 [3 ]
郑凡超 [1 ]
邓力 [2 ]
黎敬波 [1 ]
陈龙娇 [1 ]
袁淮涛 [4 ]
陈孝银 [2 ]
机构
[1] 广州中医药大学基础医学院
[2] 暨南大学中医学院
[3] 广州中医药大学第二临床医学院
[4] 广州中医药大学第一附属医院
基金
广东省自然科学基金;
关键词
16S rRNA基因测序技术; 肝阳上亢; 急性脑出血; 菌群结构; 肠道菌群; 韦恩分析; 物种水平;
D O I
10.13422/j.cnki.syfjx.20190550
中图分类号
R743.34 [脑出血];
学科分类号
1002 ;
摘要
目的:探讨肝阳上亢型急性脑出血患者与健康人群的肠道菌群差异。方法:选取2018年于广州中医药大学第一附属医院颅脑科病房收治的9例肝阳上亢型急性脑出血患者的粪便样本为观察组,同时,选取体检的6例健康人粪便样本为对照组,提取两组样本中细菌总DNA,根据16S rRNA V4区设计引物进行扩增,通过Illumina MiSeq平台进行双端测序(paired-end),通过生物信息分析软件对测序结果进行分析,比较两组样本菌群组成和结构。结果:操作分类单元(OTU)的韦恩图分析(Venn分析)显示观察组与对照组之间OTU数目存在明显差异。偏最小二乘法-判别分析(PLS-DA)显示肝阳上亢型急性脑出血患者与健康人在肠道菌群组成上具有明显差异。物种及其丰度分析上,门分类水平上观察组厚壁菌门与拟杆菌门的相对丰度比值(F/B)较正常组明显增加,其中疣微菌门的相对丰度明显低于对照组(P <0. 05)。属分类水平上,两组的普雷沃氏菌属、拟杆菌属、阿克曼氏菌属、布劳特氏菌属、氨基酸球菌属相对丰度差异有统计学意义(P <0. 05,P <0. 01),其中观察组拟杆菌属和普雷沃氏菌属的相对丰度比值(B/P)显著高于对照组。种分类水平上两组在普氏菌、阿克曼粘细菌、卵形拟杆菌、脆弱拟杆菌、伶俐瘤胃球菌上具有明显差异(P <0. 05,P <0. 01)。主坐标分析显示两组样本被显著分开,说明两组样本菌群结构存在显著差异。结论:肝阳上亢型急性脑出血与肠道菌群结构紊乱有关,其中普氏菌和阿克曼粘细菌的相对丰度下降是其发生的主要原因。
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孙文 ;
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中国实验方剂学杂志, 2017, 23 (08) :98-104
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[6]   脑出血的中西医结合临床研究进展 [J].
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Sampson, Timothy R. ;
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Thron, Taren ;
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Knight, Rob ;
Mazmanian, Sarkis K. .
CELL, 2016, 167 (06) :1469-+
[8]   Gut microbiota impact on stroke outcome: Fad or fact? [J].
Winek, Katarzyna ;
Meisel, Andreas ;
Dirnagl, Ulrich .
JOURNAL OF CEREBRAL BLOOD FLOW AND METABOLISM, 2016, 36 (05) :891-898
[9]  
Global and regional burden of stroke during 1990–2010: findings from the Global Burden of Disease Study 2010.[J].Valery L Feigin;Mohammad H Forouzanfar;Rita Krishnamurthi;George A Mensah;Myles Connor;Derrick A Bennett;Andrew E Moran;Ralph L Sacco;Laurie Anderson;Thomas Truelsen;Martin O'Donnell;Narayanaswamy Venketasubramanian;Suzanne Barker-Collo;Carlene M M Lawes;Wenzhi Wang;Yukito Shinohara;Emma Witt;Majid Ezzati;Mohsen Naghavi;Christopher Murray.The Lancet.2014, 9913
[10]  
The role of microbiome in central nervous system disorders.[J].Yan Wang;Lloyd H. Kasper.Brain Behavior and Immunity.2014,