白菜EST-SSR信息分析与标记的建立

被引：71

作者：

忻雅 ^{[1
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崔海瑞 ^{[1
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卢美贞 ^{[1
]}

姚艳玲 ^{[1
]}

金基强 ^{[1
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林容杓 ^{[2
]}

崔水莲 ^{[2
]}

机构：

[1] 浙江大学农业与生物技术学院原子核农业科学研究所

[2] 忠南大学园艺系

来源：

园艺学报 | 2006年 / 03期

关键词：

白菜; EST; SSR信息; 标记;

D O I：

10.16420/j.issn.0513-353x.2006.03.021

中图分类号：

S634.3 [白菜（小白菜）];

学科分类号：

090202 ;

摘要：

数量迅速增加的EST为开发新的SSR标记提供了宝贵的资源。本研究对4584条白菜EST进行了搜索,共检索出474个SSR,检出率为10·3%,包括40种重复基元。其中二核苷酸和三核苷酸重复单元的EST-SSR占主导地位,二者出现的频率基本相近,占总SSR的近83%;其它重复类型所占比例均不足5%。GA和GAA是二、三核苷酸中的优势重复类型,分别占二、三核苷酸重复类型的71·5%和37·5%。设计了15对EST-SSR引物,在合适的PCR反应体系下,以构建EST的白菜自交系A的DNA为模板,对设计的EST-SSR引物进行筛选,发现15对EST-SSR引物都能扩增出产物。进一步用这些可扩增的引物对28个白菜品种进行PCR扩增,发现7对引物显示多态性,占引物总数的46·7%。此结果表明,根据EST建立EST-SSR标记是一条简便而又有效的途径。

引用

页码：549 / 554

页数：6

共 14 条

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