低温对罗非鱼基因组DNA甲基化的影响

被引：22

作者：

朱华平 ^{[1
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卢迈新 ^{[1
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黄樟翰 ^{[1
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高风英 ^{[1
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可小丽 ^{[1
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刘志刚 ^{[1
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李庆勇 ^{[1
,2
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刘玉姣 ^{[1
,2
]}

机构：

[1] 中国水产科学研究院珠江水产研究所,农业部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室

[2] 上海海洋大学水产与生命学院

来源：

水产学报 | 2013年 / 37卷 / 10期

基金：

广东省自然科学基金;

关键词：

尼罗罗非鱼; 低温; DNA甲基化; 甲基化敏感扩增多态性;

D O I：

暂无

中图分类号：

S917.4 [水产动物学];

学科分类号：

0908 ;

摘要：

以经过连续多代抗寒选育获得的尼罗罗非鱼耐寒品系为实验材料,采用DNA甲基化敏感扩增多态性(methylation sensitive amplified polymorphism,MSAP)分析方法从全基因组水平上探讨了低温适应对罗非鱼DNA序列中CCGG位点的甲基化水平的影响。结果显示,选用的18对选择性扩增引物共检测到849个位点。耐寒品系检测到的位点数为411个,对照组为438个,其中发生甲基化的位点数分别为72和104个,总甲基化率分别为17.52%和23.74%;全甲基化位点分别为37个和65个,全甲基化率分别为9.00%和14.84%;半甲基化位点分别为35个和39个,半甲基化率分别为8.52%和8.90%。结果分析表明,尼罗罗非鱼耐寒品系的总甲基化水平、全甲基化水平和半甲基化水平较对照组均有一定程度的下降。与对照组相比,尼罗罗非鱼耐寒品系基因组DNA甲基化总体水平下降了6.22%,其中以全甲基化位点变异为主,其下降幅度比例明显,为5.84%。由此可见,经过连续多代的低温胁迫可导致尼罗罗非鱼DNA甲基化水平发生改变,发生了去甲基化反应,表现为基因组甲基化程度降低的特征,说明了DNA甲基化与罗非鱼抗寒性反应密切相关。

引用

页码：1460 / 1467

页数：8

共 22 条

[1] 17α-甲基睾丸酮和来曲唑对尼罗罗非鱼类固醇激素合成酶基因表达的影响 [J].