成都市首起新型冠状病毒奥密克戎变异株引起的本土聚集性疫情分析

被引:12
作者
胡敏 [1 ,2 ]
岳勇 [1 ,2 ]
王亮 [2 ]
陈振华 [2 ]
杜训波 [2 ]
冯静 [2 ]
程悦 [1 ,2 ]
庹晓莉 [1 ,2 ]
机构
[1] 中国医学科学院成都新发突发传染病防治工作站
[2] 成都市疾病预防控制中心
关键词
新型冠状病毒肺炎; 奥密克戎变异株; 流行病学;
D O I
10.16506/j.1009-6639.2022.05.003
中图分类号
R181.3 [流行病学各论]; R563.1 [肺炎];
学科分类号
100401 ; 1002 ; 100201 ;
摘要
目的 分析成都市首起新型冠状病毒(SARS-CoV-2)奥密克戎变异株引起的本土疫情的流行病学特征,为疫情防控提供参考依据。方法 收集2022年2月20日—3月2日报告的新型冠状病毒肺炎(corona virus disease 2019,COVID-19)本土病例个案信息,采用WPS 2019软件管理数据,R 4.0.3软件进行数据分析和作图。结果 基因序列分析发现,本次疫情由奥密克戎变异株(BA.2进化分支)引起,疫情波及成都市3个区,病例以18~30岁的公司职员居多,男女性别比例为0.65∶1。37例续发病例均可追溯到指示病例的密接或次密,续发病例主要通过密切接触者筛查(32例,86.49%)发现,在家庭中接触(40.54%),以共同生活(35.14%)的方式暴露,所有病例均处于同一传播链。指示病例于2月20日报告,2月21日前,发病数呈快速增长,流行病学增长率r为0.26,病例数实现倍增的时间为2.70 d。病例的潜伏期和序列间隔分布在0~6 d,平均潜伏期和序列间隔分别为2.91 d和3.03 d。实时再生数Rt值在2月17日最高(7.61),目的基因(ORF1ab、N基因)Ct的中位数分别为22.72和19.56。所有病例均接种过COVID-19疫苗,37例完成全程接种。病例分类中,阳性检测占39.47%,确诊病例的临床分型均为轻型(23例,60.53%),症状以咽痛/咽痒、咳嗽、发热多见。结论 奥密克戎变异株的序列间隔和潜伏期短,传染性强,易突破现有疫苗建立的免疫屏障,但病例症状均较轻。
引用
收藏
页码:346 / 350
页数:5
相关论文
共 5 条
[1]   一起医疗机构环境新型冠状病毒核酸阳性事件溯源调查分析 [J].
岳勇 ;
陈恒 ;
冯静 ;
吕天萍 ;
田汶佳 ;
赵辰路 ;
廖骏 ;
胡敏 ;
李君钒 ;
程悦 ;
刘辉 ;
刘竹 .
中华疾病控制杂志, 2022, (02) :238-243
[3]  
Population immunity and vaccine protection against infection[J] . Leshem Eyal,Lopman Benjamin Alan. The Lancet . 2021 (1028)
[4]  
SARS-Co V2-Omicron variant:antibody evasion and cryo-EM structure of spike protein-ACE2 complex .2 Mannar D,Saville JW,Zhu X,et al. Science . 2022
[5]  
Receptor binding and complex structures of human ACE2 to spike RBD from Omicron and Delta SARS-CoV-2 .2 HAN P,LI L,LIU S,et al. Cell . 2022