本研究扩增了169号鼠兔属样本的Cyt b基因序列,代表13个种11个亚种及5个未分类单元,下载了66条分类地位确定而完整的Cyt b基因序列,包括25种及9个亚种。构建了Bayesian系统发育树,计算了遗传距离,开展了物种界定分析;对13个种4亚种及5个未分类单元174号完整头骨和外形的20个形态学量度数据进行主成分分析、判别分析和T检验;对头骨和身体外部特征进行了比较研究。结果显示:鼠兔属包含5个亚属,分别是Ochotona,Conothoa,Pika,Lagotona和一新亚属;5个亚属间的遗传距离在12.8%-16.0%之间;高黎贡鼠兔(Ochotona gaoligongensis)是灰颈鼠兔(O.forresti)的亚种;喜马拉雅鼠兔(O.himalayana)是灰鼠兔(O.roylei)的亚种;木里鼠兔(O.muliensis)是川西鼠兔(O.gloveri)的亚种;宁夏鼠兔(O.argentata)应为蒙古鼠兔(O.pallasi)的亚种;西伯利亚鼠兔(O.turuchanensis)为高山鼠兔(O.alpina)的同物异名。藏鼠兔循化亚种(O.thibetana xunhuaensis)应提升为种:循化鼠兔(O.xunhuaensis);东北鼠兔长白山亚种(O.hyperborea coreana)应该提升为种:长白山鼠兔(O.coreana);藏鼠兔峨眉亚种(O.thibetana sacraria)应提升为种:峨眉鼠兔(O.sacraria);藏鼠兔锡金亚种(O.thibetana sikimaria)应提升为种:锡金鼠兔(O.sikimaria)。通过分子系统学和形态学研究,发现了鼠兔属1新亚属和5个新种。新亚属命名为异耳鼠兔亚属(Alienauroa subgen.n.),属模为黄龙鼠兔(O.huanglongensis sp.n.),成员包括黄龙鼠兔新种、峨眉鼠兔、循化鼠兔,以及在龙门山和大巴山发现的2个新种,共计5个种。新亚属的鉴定特征是:耳上前缘内侧有一个密被短毛的异耳屏(Congenial tragus);头骨扁平,颅面平直;眼小,眼眶长和眼眶宽均小于其他亚属;被毛粗长而无光泽;腹毛多为灰白色。5个新种分别发现于四川黄龙自然保护区、四川北部龙门山、四川北部大巴山、四川西部邛崃山、西藏雅鲁藏布江中游的朗县。我们分别将其命名为黄龙鼠兔(Ochotona huanglongensis sp.n.)、扁颅鼠兔(Ochotona flatcalvariam sp.n.)、大巴山鼠兔(Ochotona dabashanensis sp.n.)、雅鲁藏布鼠兔(Ochotona yarlungensis sp.n.)和邛崃鼠兔(Ochotona qionglaiensis sp.n.)。黄龙鼠兔的鉴定特征是:门齿孔前段平行;脑颅扁平,颅高为颅全长的33.5%;耳大,平均20 mm以上(不含耳基部的管),异耳屏三角形,但顶端圆形;毛长而粗糙,无光泽,背部毛长约20 mm;腹面毛色以灰白为主;前后足背面灰白色,腹面黑灰色,指(趾)垫大,橘黄色,露出毛外,爪黄白色半透明。扁颅鼠兔的鉴定特征是:脑颅异常扁平,颅高约11 mm,颅高仅为颅全长的31%;眼眶很小,平均6.7 mm×5.6 mm;个体小,体长140 mm以下;体毛长而粗糙无光泽,背部毛长22 mm;耳小,平均17 mm左右,异耳屏阔圆型,相对较小;背毛沙黄色,腹毛黄白。大巴山鼠兔的鉴定特征是:异耳屏镰刀状;耳相对较小,均在17 mm以下,和峨眉鼠兔、扁颅鼠兔差不多,比该亚属循化鼠兔和黄龙鼠兔小。颅高相对较大,颅面更隆突,颅高平均12.45 mm,眼眶相对较大,平均8.52 mm×7.13 mm。雅鲁藏布鼠兔的鉴定特征是:与黑唇鼠兔(O.curzoniae)和努布拉克鼠兔拉萨亚种(O.nubrica lhasaensis)有很近的亲缘关系;唇缘有很窄的深灰色圈,深灰色圈外侧为灰白色;前后足底部毛浓密,趾端毛多而长,趾垫和爪隐于毛中;个体中等,体长150 mm左右,比黑唇鼠兔和努布拉克鼠兔拉萨亚种小得多;颅面较隆突,但与黑唇鼠兔相比,颅面相对平直;被毛黑褐色。邛崃鼠兔的鉴定特征是:大小及头骨和藏鼠兔很相似,但该种和藏鼠兔的显著不同是眶间宽狭窄,平均4.05(3.64-4.19)mm,而藏鼠兔眶间宽一般超过4.2 mm,平均为4.45 mm;该种毛色为沙色带黄色调,毛粗长;藏鼠兔为黑褐色调,毛相对较短;邛崃鼠兔前后足背面为显著的草黄色,而藏鼠兔前后足背面黄白色。
