miR-127-3p对C2C12细胞成肌分化和转录组的影响

被引:5
作者
宋天增 [1 ]
李杰 [2 ]
马金英 [1 ]
蒋婧 [2 ]
王高富 [2 ]
付琳 [2 ]
周鹏 [2 ]
马友记 [3 ]
任航行 [2 ]
机构
[1] 西藏自治区农牧科学院畜牧兽医研究所
[2] 重庆市畜牧科学院草食牲畜研究所
[3] 甘肃农业大学动物科学技术学院
关键词
RNA-Seq; microRNA; 过表达; C2C12; 成肌分化;
D O I
暂无
中图分类号
Q75 [分子遗传学];
学科分类号
071007 ;
摘要
前期研究表明,miR-127-3p参与骨骼肌细胞分化的调控,但对于miR-127-3p调控的靶基因及其在成肌分化中的作用还不清楚。应用qRT-PCR与细胞形态学方法研究过表达miR-127-3p对C2C12成肌细胞分化及成肌标志基因MyoD、MyoG和Myosin表达的影响;RNA-Seq分析过表达miR-127-3p对成肌细胞转录组的影响,鉴定差异表达基因并对其功能进行初步研究。结果表明,过表达miR-127-3p显著促进C2C12细胞的成肌分化与MyoD、MyoG和Myosin表达;RNA-Seq分析共鉴定到3个差异基因,均为下调基因,其中包括2个转录因子(Irf7和Ddit3)。GO与KEGG分析显示,这些差异基因显著富集于免疫和能量代谢过程/信号通路。生物信息学分析发现,miR-127-3p可与Ddit3基因的CDS区发生碱基互补配对,进而抑制其表达。表明在转录组水平上,miR-127-3p可能通过直接靶向Ddit3基因/转录因子调控免疫与能量代谢类基因的表达,进而调节成肌细胞分化。
引用
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