仿刺参的微卫星标记

被引：21

作者：

战爱斌

包振民

陆维

汪小龙

胡景杰

机构：

[1] 中国海洋大学生命科学与技术学部海洋生物遗传与种质工程实验室

来源：

水产学报 | 2006年 / 02期

关键词：

仿刺参; 微卫星标记; 多态性; 通用性;

D O I：

暂无

中图分类号：

S917.4 [水产动物学];

学科分类号：

0908 ;

摘要：

为了评价种质资源及基础生物学研究的需要,本文开发了仿刺参的微卫星标记。NCBI数据库中共有20个含有仿刺参微卫星的序列,从中选取8个设计引物,发现6个微卫星位点有多态性。不同的引物获得的等位基因数为3～9个不等,6个位点共获得了31个等位基因,每个位点平均获得5.2个等位基因。6个位点的平均观测杂合度(Ho)为0.3611,平均期望杂合度(He)为0.6402。位点AJMS004提供的多态性信息含量值较低,为0.4862;其他5个位点均在0.5以上。另外,还尝试了红海参(Parastichopus californicus)微卫星标记在仿刺参的通用性。实验结果表明,在较高的退火温度下,5对引物均能扩增仿刺参的基因组DNA并具多态性。5个位点共获得了22个等位基因,每个位点平均获得4.4个等位基因。5个位点的平均观测杂合度(Ho)为0.1733,平均期望杂合度(He)为0.4201。其中位点Psc2的多态性信息含量值最高,为0.8500。

引用

页码：192 / 196

页数：5