陆地棉叶绿体基因组密码子使用偏性的分析

被引：99

作者：

尚明照 ^{[1
,2
]}

刘方 ^{[2
]}

华金平 ^{[3
]}

王坤波 ^{[2
]}

机构：

[1] 华中农业大学植物科学技术学院

[2] 中国农业科学院棉花研究所

[3] 中国农业大学农学与生物技术学院

来源：

中国农业科学 | 2011年 / 44卷 / 02期

关键词：

陆地棉; 密码子偏性; GC含量; 最优密码子;

D O I：

暂无

中图分类号：

S562 [棉];

学科分类号：

0901 ;

摘要：

【目的】通过分析陆地棉叶绿体基因组密码子使用偏性,探讨影响密码子偏性形成的主要因素。【方法】以陆地棉叶绿体基因组为研究对象,利用Mobyle及其它软件,分析叶绿体50个基因密码子的使用模式。【结果】陆地棉叶绿体基因组密码子GC1与GC2之间的相关系数达到极显著水平,GC3含量最低,与GC12的相关系数为0.14,双尾检验未达到显著水平;单个基因ENC比值多分布在-0.05—0.05;对应性分析,第一轴上显示了10.27%的差异,与GC3、ENC的相关系数分别为0.223和-0.147,均未达到显著水平。【结论】陆地棉叶绿体密码子第三位偏好使用嘧啶,而最优密码子多以A或T结尾;密码子使用模式可能是由选择和突变及其它因素共同作用形成的。

引用

页码：245 / 253

页数：9

共 21 条

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