基于网络药理学和分子对接技术初步探索“清肺排毒汤”抗新型冠状病毒肺炎作用机制

被引:120
作者
吴昊 [1 ]
王佳琪 [1 ]
杨雨薇 [1 ]
李天怡 [1 ]
曹一佳 [1 ]
曲玉霞 [1 ]
靳玉洁 [2 ]
张晨宁 [1 ,2 ]
孙毅坤 [1 ]
机构
[1] 北京中医药大学中药学院
[2] 十堰市太和医院湖北医药学院附属医院
关键词
新型冠状病毒肺炎; 清肺排毒汤; 网络药理学; 分子对接技术; 机制初探;
D O I
10.16438/j.0513-4870.2020-0136
中图分类号
R285 [中药药理学];
学科分类号
1008 ;
摘要
利用中药网络药理学和分子对接技术初步探索"清肺排毒汤"抗新型冠状病毒肺炎(coronavirus disease2019, COVID-19)作用机制。结合中国药典(2015版)以及中药系统药理学数据库及分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology, TCMSP)、OMIM (Online Mendelian Inheritance in Man)、GeneCard、STRING等在线数据库,进行一系列网络构建、核心靶点筛选以及信号通路富集分析,最后对重要化合物进行分子对接预测。结果发现,清肺排毒汤化合物-肺炎靶点网络包含292个化合物和相应靶点214个,核心靶点涉及AKT1 (AKT serine/threonine kinase 1)、IL6 (interleukin 6)、MAPK8 (mitogen-activated protein kinase 8)、MAPK1 (mitogen-activated protein kinase 1)和JUN (jun proto-oncogene)等。应用GO (Gene Ontology)数据库功能富集分析得到858个GO条目,应用KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)数据库富集筛选得到122条有关通路,其中包含低氧诱导因子-1 (hypoxia inducible factor-1, HIF-1)通路、Toll样受体(Toll-like receptors, TLRs)通路等已报道与肺炎相关的通路,也包括T细胞受体(T-cell receptor, TCR)通路等与肺损伤保护相关的通路。分子对接结果显示,清肺排毒汤中药材部分核心化合物对新型冠状病毒(2019-nCoV)的3C类似蛋白酶(3C-like protease, 3CLpro)和血管紧张素转换酶2 (angiotensin-converting enzyme 2, ACE2)蛋白具有一定的亲和力。本文初步探索了清肺排毒汤抗COVID-19的作用机制,且预测了其药效物质基础,期待本结果能为进一步确证清肺排毒汤抗COVID-19有效成分和作用机制提供帮助。
引用
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页码:374 / 383
页数:10
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