广东地区GBV-C/HGV5′NCR区序列变异的研究

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作者
付涌水
曹开源
吕凌
机构
[1] 广东省广州血液中心!
[2] 中山医科大学分子医学研究中心!
关键词
克隆,分子; 序列分析,DNA; 肝炎病毒组; 庚型; 聚合酶链反应;
D O I
10.13820/j.cnki.gdyx.2000.05.015
中图分类号
R512.6 [病毒性肝炎];
学科分类号
摘要
目的 了解广东地区GBV -C/HGV 5′NCR区的序列变异情况。方法 以GBV -C和HGV的 5′NCR区完全同源的序列设计合成引物用于套式RT -PCR。从广东地区的 10例GBV -C/HGV感染者血中扩增了 10个序列 ,分别克隆至pUC19或pT -Adv载体。以 3 5S标记的双脱氧链末端终止法对这 10个序列分别进行正反两个方向的序列测定。结果  10株序列相互间同源性最大为 10 0 % ,最小为 84 4%。与Genbank所载 3个标准株的相应序列比较 ,其同源性最大为89 4% ,最小为 83 9%。与国内周育森报道的相应序列比较 ,两者之间的同源性最大为 96 1% ,最小为 85 0 %。比较还发现 ,这 10株序列的起始处有一段 3 8nt的区域与上述标准序列相比变异比较大 ,其与标准序列的同源性最高只有 79 0 % ,最低为 60 5 %。其中 9株相互间的这一 3 8nt序列的同源性则高达 92 %~ 10 0 %。结论 广东地区流行的庚型肝炎病毒大多带有HGV的特殊点。少数为GBV -C
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共 2 条
  • [1] SimonsJN,LearyTP,DawsonGJ,etal.Isolationofnovelvirus-likese quencesassociatedwithhumanhepatitis. Natural Medicines . 1 995
  • [2] LearyTP,MuerhoffAS,SimmonsJN,etal.Sequenceandgenomicorganiza tionofGBV -C:anovelmemberoftheflaviviridaeassociatedwithhumannon-AEhepatitis. JMedVirol . 1 996