两种二倍体野生花生ABI3/VP1的全基因组鉴定与分析

ABI3/VP1在植物生长发育过程中起重要调节作用。该研究以模式生物拟南芥为参考，在2个二倍体野生花生的全基因组序列中鉴定了ABI3/VP1基因家族成员，并用一系列生物信息学方法对其进行了系统发育、理化性质、二级结构预测、染色体定位及启动子顺式作用元件分析。研究成功从花生基因组中鉴定出17个ABI3/VP1基因，这些基因不均匀地分布在11条染色体上。与拟南芥相比，花生的ABI3/VP1基因数量较多，可能由于两者祖先物种分歧时的基因丢失或加倍。系统发育分析表明，花生古老支中的许多基因与拟南芥有较近的亲缘关系。观察两个不同的花生种在三个亚家族中的分布，发现Adu和Aip两种在古老支中的基因数量相同，但在中间支和现代支中，Aip的基因数量明显小于Adu。这可能是由于地理差异或种间相关基因的差异。值得注意的是，Aip的相关基因从中间支到现代支经历了数量变化，推测这与基因的丢失或古老基因的加倍与进化有关。花生ABI3/VP1基因被推测参与多个信号通路，调控花生的生长发育过程和对环境刺激的响应。研究结果为后续开展花生ABI3/VP1基因调控脱落酸信号转导相关的研究提供了科学依据，对花生生长发育与果实成熟具有重要意义。