scRNA-seq和Bulk RNA-seq联合分析揭示MTRNR2L1介导COPD进展中PANoptosis下调

被引:0
作者
戈艳蕾 [1 ]
孙思怡 [1 ]
任泓沁 [1 ]
姚雪鑫 [1 ]
赵倩 [1 ]
李文强 [2 ]
陈伟彬 [3 ]
白静 [4 ]
喻昌利 [1 ]
董爱英 [5 ]
刘铁军 [6 ]
付爱双 [1 ]
机构
[1] 华北理工大学附属医院呼吸与危重症医学科
[2] 自贡市第一人民医院呼吸与危重症医学科
[3] 华北理工大学附属医院CT室
[4] 华北理工大学附属医院重症医学科
[5] 华北理工大学附属医院微生物室
[6] 华北理工大学附属医院麻醉科
关键词
慢性阻塞性肺疾病; 肺损伤; PANoptosis; 单细胞RNA测序; 批量RNA测序;
D O I
暂无
中图分类号
R563.9 [其他];
学科分类号
1002 ; 100201 ;
摘要
目的:探讨慢性阻塞性肺疾病(chronic obstructive pulmonary disease,COPD)发展过程中MT-RNR2样蛋白1(MT-RNR2 like protein 1,MTRNR2L1)介导的泛凋亡(PANoptosis)调控机制,为寻找COPD发病机制提供新思路。方法:通过基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)中COPD患者的批量RNA测序(Bulk RNA sequencing,Bulk RNA-seq)数据和单细胞RNA测序(single cell RNA sequencing,sc RNA-Seq)数据探究COPD患者肺组织中细胞构成,并分析细胞参与疾病发生的相关通路。在烟雾/脂多糖(lipopolysaccharide,LPS)暴露的小鼠中模拟PANoptosis,评估MTRNR2L1和PANoptosis蛋白表达情况,明确其在COPD发生发展中的作用。结果:Bulk RNA-seq显示COPD患者T细胞反应相关基因的表达变化。sc RNA-Seq证实与对照组相比,COPD组的CD8+T细胞数减少,上皮细胞数增加;MTRNR2L1在COPD患者的免疫细胞和上皮细胞中表达水平上调;COPD患者肺组织、CD8+T细胞和上皮细胞中的PANoptosis相关基因表达水平降低。暴露于烟雾/LPS的小鼠肺表现出肺泡损伤、PANoptosis蛋白表达上调,MTRNR2L1过表达显著抑制细胞PANoptosis并下调ZBP1、Caspase-3、GSDMD和MLKL的水平。结论:CD8+T细胞与上皮细胞的差异表达基因分别在泛凋亡相关通路富集,提示PANoptosis参与COPD的发生发展,COPD发病过程中PANoptosis与PANoptosis蛋白表达增高相关,MTRNR2L1对PANoptosis有抑制作用,调节PANoptosis可能为减轻肺损伤和改善肺通气功能提供新的治疗机会。
引用
收藏
页码:786 / 797
页数:12
相关论文
共 2 条
[1]   探讨AECOPD患者血清ACE2和NLR水平与CAT评分的相关性 [J].
段榆琳 ;
王宋平 .
南京医科大学学报(自然科学版), 2019, 39 (07) :997-999
[2]   microRNA let-7在COPD稳定期男性患者血清中的表达及临床意义 [J].
张哲明 ;
吴艳 ;
邸婷婷 ;
范晓东 ;
郁震 ;
吴霞 ;
王春新 ;
邵耀明 ;
杨玥 ;
卞涛 .
南京医科大学学报(自然科学版), 2023, 43 (02) :230-235