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- [1] 栽培远志qRT-PCR内参基因筛选与P450s基因的时空表达分析[J]. 中草药, 2019, 50 (24) : 6084 - 6090李娟孔冉冉梅月菊张福生田洪岭秦雪梅杜晨晖马存根
远志R2R3-MYB基因家族的鉴定和分析
被引：0
|作者：
任大棒
[1
]
李娟
[2
]
张建琴
[1
]
秦雪梅
[1
]
李彦青
[3
]
卫罡
[4
,5
]
张福生
[1
]
机构：
[1] 山西大学中医药现代研究中心
[2] 山西药科职业学院
[3] 山西中医药大学基础医学院
[4] 山西省药品检查中心
[5] 山西省医药与生命科学研究院
来源：
关键词：
远志;
转录因子;
R2R3-MYB;
生物信息学;
基因表达;
D O I：
暂无
中图分类号：
S567.239 [];
学科分类号：
摘要：
目的：挖掘影响远志次生代谢物生物合成的转录因子。方法：以远志根和茎叶为材料，利用生物信息学软件构建远志2+3代转录组数据库，鉴定含编码区(CDS)的全长远志R2R3-MYB转录因子，筛选远志次生代谢物相关的R2R3-MYB转录因子，并利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)进行表达模式分析。结果：远志3代全长转录组获得了20 Gb的Clean data和225 681个非冗余Unigenes,平均长度为2 592 bp; 2代比较转录组获得了17 901个与远志根、茎叶中化学成分差异相关的基因，包括5 337个上调基因，12 564个下调基因。基于上述转录组，共鉴定出18个含CDS全长的R2R3-MYB转录因子，并发现其分布于S1、S3、S4、S6、S7、S11、S18、S20等8个亚族中。经qRT-PCR分析表明，远志R2R3-MYB基因在根和茎叶中的表达具有显著性差异。结论：远志R2R3-MYB中的PtMYB12和PtMYB14正向调节黄酮类，PtMYB7、PtMYB15和PtMYB17正向调节角质层。该研究为后续深入研究远志R2R3-MYB基因家族的调控机制以及远志优良品种的选育提供了理论参考。
引用
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页码：1915 / 1920
页数：6
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