去泛素酶复合体Ubp3/Bre5的制备及与Cdc48作用(英文)

被引:0
|
作者
苏文成 [1 ,2 ]
吕操 [1 ,2 ]
时丽丽 [3 ]
景晓飞 [1 ,2 ]
盖园明 [2 ]
张洁 [2 ]
谭焕波 [2 ]
王鹏举 [2 ]
夏立新 [4 ,5 ]
邹培建 [2 ]
秦刚 [2 ]
机构
[1] 天津工业技术大学生物技术学院
[2] 中国科学院天津工业生物技术研究所,国家工业酶重点实验室
[3] 天津药物研究院天津分子设计与药物发现重点实验室
[4] 深圳大学医学部,呼吸疾病国家重点实验室
[5] 深圳大学变态反应分室
关键词
结合蛋白质; Ubp3去泛素化酶; 结合辅因子Bre5; ATP酶Cdc48; 去泛素化复合体; 与谷光苷肽巯基转移酶沉淀试验; 直接相互作用;
D O I
暂无
中图分类号
Q55 [酶];
学科分类号
摘要
泛素化是一种存在于真核细胞中与生理功能密切相关的蛋白修饰,泛素化与去泛素化处于动态调节过程中.Ubp3是与人USP10同源的酵母去泛素化酶,结合辅引子Bre5在细胞内发挥广泛作用.为研究该复合体的工作机制,制备重组蛋白复合体,在大肠杆菌中成功表达并纯化重组Ubp3与Bre5单体及Ubp3/Bre5复合体,首次成功大规模制备重组Ubp3/Bre5复合体.通过一系列pulldown实验,检验Ubp3/Bre5与AAA家族中泛素选择性ATP酶Cdc48的相互作用模式,结果发现,Ubp3及Bre5无法单独与Cdc48结合,但Ubp3/Bre5复合体可以有效与Cdc48相互作用.提出了Ubp3/Bre5-Cdc48相互作用的新模式,制备了高质量重组Ubp3/Bre5复合体.该研究为通过生化及结构生物学进行分子机制探索奠定了基础.
引用
收藏
页码:58 / 67
页数:10
相关论文
共 11 条
  • [1] Comprehensive profiling of proteome changes upon sequential deletion of deubiquitylating enzymes
    Poulsen, Jon W.
    Madsen, Christian T.
    Young, Clifford
    Kelstrup, Christian D.
    Grell, Heidi C.
    Henriksen, Peter
    Juhl-Jensen, Lars
    Nielsen, Michael L.
    [J]. JOURNAL OF PROTEOMICS, 2012, 75 (13) : 3886 - 3897
  • [2] Hierarchical Binding of Cofactors to the AAA ATPase p97
    Haenzelmann, Petra
    Buchberger, Alexander
    Schindelin, Hermann
    [J]. STRUCTURE, 2011, 19 (06) : 833 - 843
  • [3] Cdc48: a power machine in protein degradation[J] . Alexandra Stolz,Wolfgang Hilt,Alexander Buchberger,Dieter H. Wolf.Trends in Biochemical Sciences . 2011 (10)
  • [4] Regulation and Cellular Roles of Ubiquitin-Specific Deubiquitinating Enzymes[J] . Francisca E. Reyes-Turcu,Karen H. Ventii,Keith D. Wilkinson.Annual Review of Biochemistry . 2009
  • [5] Reversal of RNA polymerase II ubiquitylation by the ubiquitin protease ubp3
    Kvint, Kristian
    Uhler, Jay P.
    Taschner, Michael J.
    Sigurdsson, Stefan
    Erdjument-Bromage, Hediye
    Tempst, Paul
    Svejstrup, Jesper Q.
    [J]. MOLECULAR CELL, 2008, 30 (04) : 498 - 506
  • [6] The Bre5/Ubp3 ubiquitin protease complex from budding yeast contributes to the cellular response to DNA damage
    Bilsland, Elizabeth
    Hult, Malin
    Bell, Stephen D.
    Sunnerhagen, Per
    Downs, Jessica A.
    [J]. DNA REPAIR, 2007, 6 (10) : 1471 - 1484
  • [7] Molecular basis for bre5 cofactor recognition by the ubp3 deubiquitylating enzyme
    Li, Keqin
    Ossareh-Nazari, Batool
    Liu, Xin
    Dargemont, Catherine
    Marmorstein, Ronen
    [J]. JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY, 2007, 372 (01) : 194 - 204
  • [8] Functional Division of Substrate Processing Cofactors of the Ubiquitin-Selective Cdc48 Chaperone[J] . Sebastian Rumpf,Stefan Jentsch.Molecular Cell . 2006 (2)
  • [9] A genomic and functional inventory of deubiquitinating enzymes
    Nijman, SMB
    Luna-Vargas, MPA
    Velds, A
    Brummelkamp, TR
    Dirac, AMG
    Sixma, TK
    Bernards, R
    [J]. CELL, 2005, 123 (05) : 773 - 786
  • [10] Ubiquitination and deubiquitination: Targeting of proteins for degradation by the proteasome[J] . Keith D. Wilkinson.Seminars in Cell and Developmental Biology . 2000 (3)